RNA–Protein interactions for RNA: YGL008C

PMA1, Transcript of Plasma membrane P2-type H+-ATPase, yeast

Gene PMA1, Length 2,757 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PMA1	YGL008C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	SAC7	P17121	654 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	UBC8	P28263	218 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	GSH1	P32477	678 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
PMA1	YGL008C	YKL071W	P36086	256 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	TSC10	P38342	320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	SPL2	P38839	148 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	PHO90	P39535	881 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	TDA10	P42938	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	FAR3	P46671	204 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	YGL159W	P53110	370 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	CTF19	Q02732	369 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	SYO1	Q07395	620 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	IZH3	Q07959	543 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	FKS3	Q04952	1785 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	SPS4	P09937	338 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	SNF6	P18888	332 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	TOA2	P32774	122 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	ATO2	P32907	282 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	HMT1	P38074	348 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
PMA1	YGL008C	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	NIF3	P53081	288 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	SED5	Q01590	340 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	SSY1	Q03770	852 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	NAT4	Q04751	285 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	DXO1	Q06349	442 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	SOR2	Q07786	357 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	RSF2	P46974	1380 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	CHO1	P08456	276 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	RTC2	P38279	296 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	SPC97	P38863	823 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	YNL194C	P40169	301 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	POG1	P40473	351 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	PHO86	P46956	311 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	RIM8	P53179	542 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	GIS1	Q03833	894 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	COR1	P07256	457 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	PDR3	P33200	976 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	LHS1	P36016	881 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	COX18	P53239	316 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	YNL181W	P53878	407 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	CUZ1	P53899	274 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	VPS74	Q06385	345 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	NCA2	Q12374	616 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	PNS1	Q12412	539 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	TRM11	Q12463	433 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	SNF8	Q12483	233 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	PDE2	P06776	526 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	YHL012W	P38709	493 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	LNP1	P38878	278 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	YER184C	P39961	794 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	YMR134W	P40207	237 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	PKP2	P53170	491 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	MPS1	P54199	764 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	INM2	Q05533	292 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	ATP10	P18496	279 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	CMK2	P22517	447 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	YKL187C	P34231	750 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	YGR210C	P42942	411 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	TIS11	P47977	285 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	CAC2	Q04199	468 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	ECI1	Q05871	280 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	TAF10	Q12030	206 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	SNF3	P10870	884 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	TYR1	P20049	452 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	PDE1	P22434	369 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	MET22	P32179	357 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	PRE3	P38624	215 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	HIS2	P38635	335 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	ATG7	P38862	630 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	UBP8	P50102	471 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	YTP1	P53584	459 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	TEN1	Q07921	160 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PMA1	YGL008C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63

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