RNA–Protein interactions for RNA: YER116C

SLX8, Transcript of Subunit of Slx5-Slx8 SUMO-targeted ubiquitin ligase (STUbL) complex, yeast

Gene SLX8, Length 825 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX8	YER116C	LDS2	Q08218	356 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	IRC13	Q08630	104 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	YOR387C	Q08910	206 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	PER33	Q12144	273 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	YDL177C	Q12257	170 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	SNA3	P14359	133 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	TYR1	P20049	452 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	RPB8	P20436	146 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	GIT1	P25346	518 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	CTR86	P25355	563 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	SKN1	P33336	771 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	MRPS5	P33759	307 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	CBP4	P37267	147 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	APL3	P38065	1025 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	FES1	P38260	290 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	TRM5	P38793	499 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	SRP14	P38985	146 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	NDC80	P40460	691 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	ICE2	P40499	491 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	TRS85	P46944	698 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	BUD32	P53323	261 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	YTP1	P53584	459 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	ERG5	P54781	538 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	SED5	Q01590	340 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	GIS1	Q03833	894 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	YDR387C	Q04162	555 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	PEX12	Q04370	399 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	WHI2	P12611	486 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	STE4	P18851	423 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	RBK1	P25332	333 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	RAD24	P32641	659 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	MNS1	P32906	549 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	PDR3	P33200	976 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	YOX1	P34161	385 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	YKL097C	P34245	136 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	SOK1	P40317	901 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	POG1	P40473	351 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	AZR1	P50080	613 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	VEL1	P53058	206 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	YPR003C	P53394	754 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	MMT1	Q03218	510 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	DLT1	Q04216	342 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	YDL114W	Q07530	308 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	YLL056C	Q12177	298 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	SET6	Q12529	373 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	YOR338W	Q99326	363 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	ECM5	Q03214	1411 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	CDC6	P09119	513 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	SNF3	P10870	884 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	FAR1	P21268	830 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	MBR1	P23493	339 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	PTP1	P25044	335 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	MRPL9	P31334	269 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	NDC1	P32500	655 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	ROT2	P38138	954 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	FZO1	P38297	855 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	COX15	P40086	486 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	HOC1	P47124	396 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	YJR149W	P47177	404 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	TOS2	P50078	622 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	PHB2	P50085	310 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	VPS62	P53285	467 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	CTF19	Q02732	369 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	YPL080C	Q02826	108 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	YDR209C	Q03480	137 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	CAC2	Q04199	468 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	PEX10	Q05568	337 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	HRD3	Q05787	833 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	PLB3	Q08108	686 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	ESA1	Q08649	445 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	YLR049C	Q12110	428 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
SLX8	YER116C	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
SLX8	YER116C	TPK3	P05986	398 aa		3.71	□□□□□ -1.82

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