RNA–Protein interactions for RNA: YDL113C

ATG20, Transcript of Sorting nexin family member, yeast

Gene ATG20, Length 1,923 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG20	YDL113C	ARO7	P32178	256 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	PRO1	P32264	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	SFA1	P32771	386 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	AIM20	P40451	204 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	YFL054C	P43549	646 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	NUP49	Q02199	472 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	SNZ1	Q03148	297 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	RNH202	Q05635	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	RSC58	Q07979	502 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	TRM10	Q12400	293 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
ATG20	YDL113C	COX3	P00420	269 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	MGR1	P25573	417 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	BUB3	P26449	341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	LOT5	P34234	306 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	OMA1	P36163	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	WSC4	P38739	605 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	RRG9	P40156	214 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	LRO1	P40345	661 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	ASK10	P48361	1146 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	NIT3	P49954	291 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	TWF1	P53250	332 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	SPC19	Q03954	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	ARO10	Q06408	635 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	SRO7	Q12038	1033 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	DIN7	Q12086	430 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	BSC1	Q12140	328 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	RBD2	Q12270	262 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	SFM1	Q12314	213 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	MDM35	O60200	86 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	GAL7	P08431	366 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	AAC3	P18238	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	RNQ1	P25367	405 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	YCL002C	P25565	263 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	PUP2	P32379	260 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	YPK3	P38070	525 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	ARN2	P38724	620 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	MNL1	P38888	796 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	YAL037W	P39728	267 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	YAP1802	P53309	568 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	SWS2	P53937	143 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
ATG20	YDL113C	REC102	Q02721	264 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	GPI17	Q04080	534 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	RPC82	P32349	654 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	RIB7	P33312	244 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	SKN1	P33336	771 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	FES1	P38260	290 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	ELO1	P39540	310 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	TOS2	P50078	622 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	YGR045C	P53229	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	YGR168C	P53293	376 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	HOL1	P53389	586 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	ASI1	P54074	624 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	NAT4	Q04751	285 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	PUS9	Q12069	462 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	SIA1	Q12212	622 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	YOL107W	Q12239	342 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	REP1	P03871	373 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	NDC1	P32500	655 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	ECM34	P38728	170 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	YLF2	P38746	405 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	FMO1	P38866	432 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	FMP52	P40008	231 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	YJL068C	P40363	299 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	YPS6	P40583	537 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	NCE103	P53615	221 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	SRL4	Q03085	281 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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