RNA–Protein interactions for RNA: YBR215W

HPC2, Transcript of Subunit of the HIR complex, yeast

Gene HPC2, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HPC2	YBR215W	EXG2	P52911	562 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	YPR003C	P53394	754 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	OCA2	P53949	197 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	HRD3	Q05787	833 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	MET2	P08465	486 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	ERG11	P10614	530 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	PCT1	P13259	424 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	PDE1	P22434	369 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	PCA1	P38360	1216 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	PRE3	P38624	215 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	GOS1	P38736	223 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	OXA1	P39952	402 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	HAT2	P39984	401 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	ROG1	P53118	685 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	NUP49	Q02199	472 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	CCE1	Q03702	353 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	PLM2	Q04383	521 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	FRQ1	Q06389	190 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	POM33	Q12164	279 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	NCA2	Q12374	616 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	COX3	P00420	269 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	CUP2	P15315	225 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	EHD3	P28817	500 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	MRX3	P38172	270 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	VHC1	P38329	1120 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	DSE1	P40077	573 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	AAT1	Q01802	451 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	BUR2	Q05949	395 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	TPO3	Q06451	622 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	OPT2	Q06593	877 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	ASR1	Q06834	288 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	ELG1	Q12050	791 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	RMD5	Q12508	421 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	GPA2	P10823	449 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	SPC34	P36131	295 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	EHT1	P38295	451 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	GPI16	P38875	610 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	GUF1	P46943	645 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	YDL186W	P48568	277 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	COG5	P53951	403 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	YMR279C	Q03263	540 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	SSK1	Q07084	712 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	ARG82	P07250	355 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	PUT2	P07275	575 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
HPC2	YBR215W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	HCM1	P25364	564 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	PPZ1	P26570	692 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	DRE2	P36152	348 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	SHG1	P38337	142 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	HIS2	P38635	335 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	YHR177W	P38867	453 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	AIM2	P39721	246 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	DDI1	P40087	428 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	PFA3	P42836	336 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	LSB6	P42951	607 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	UFD1	P53044	361 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	JAC1	P53193	184 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	DPP1	Q05521	289 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	ACM1	Q08981	209 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	RPO31	P04051	1460 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	RTG1	P32607	177 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	GIC1	P38785	314 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	VPS52	P39904	641 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	BMT5	P40493	336 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	YGR210C	P42942	411 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	CIN2	P46670	268 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	PHO86	P46956	311 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	TAX4	P47030	604 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	MTC3	P53077	123 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HPC2	YBR215W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.5 ms