RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	COG1	P53079	417 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	ATG4	P53867	494 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	FMP30	Q02883	468 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	GRX3	Q03835	250 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	EMI1	Q04406	187 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	RNH1	Q04740	348 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	SNO4	Q04902	237 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	YLR012C	Q07927	99 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	HSP32	Q08992	237 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	RKI1	Q12189	258 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	SUL2	Q12325	893 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	UBR1	P19812	1950 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	PUT2	P07275	575 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	YCR061W	P25639	631 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	LOT5	P34234	306 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	HCS1	P34243	683 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	YBR056W	P38081	501 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	YBR225W	P38321	900 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	VPS25	P47142	202 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	SRB7	P47822	140 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	TIS11	P47977	285 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	IPI3	P53877	555 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	PIR3	Q03180	325 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	ABZ2	Q03266	374 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	YMR010W	Q03687	405 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	YOL073C	Q08232	322 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	YOL131W	Q08270	108 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	TGS1	Q12052	315 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	YDL199C	Q12407	687 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	TIM9	O74700	87 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	AAC3	P18238	307 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	GPX2	P38143	162 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	SDH8	P38345	138 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	PCL5	P38794	229 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	UBA4	P38820	440 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	PET100	P38958	111 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	TVP23	P38962	199 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	MPM1	P40364	252 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	IME4	P41833	600 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	MEP2	P41948	499 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	IRC6	P43615	237 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	YIP4	P53093	235 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	CPR8	P53728	308 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	BSC5	P53755	489 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	IGO1	P53897	168 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	REG1	Q00816	1014 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	COS7	Q07788	383 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	GLE1	Q12315	538 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	HSP42	Q12329	375 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	PNS1	Q12412	539 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	SKM1	Q12469	655 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	DST1	P07273	309 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	RSR1	P13856	272 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	MET8	P15807	274 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	MRPL8	P22353	238 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	PDE1	P22434	369 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	RBK1	P25332	333 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	TY2A-C	P25383	438 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	YCR087C-A	P37263	153 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	SIF2	P38262	535 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	RCK1	P38622	512 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	SPO73	P40031	143 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	COG3	P40094	801 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	SOK1	P40317	901 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	5.34	□□□□□ -1.55	not detected
PSH1	YOL054W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	RMD8	P43620	662 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	SIP4	P46954	829 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	PRM8	P53174	237 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	YGR168C	P53293	376 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	SNF12	P53628	566 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	BUD17	P53727	317 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	YNL181W	P53878	407 aa		5.34	□□□□□ -1.55

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