RNA–Protein interactions for RNA: YLR119W

SRN2, Transcript of Component of the ESCRT-I complex, yeast

Gene SRN2, Length 642 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SRN2	YLR119W	YFH1	Q07540	174 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SRN2	YLR119W	MFG1	Q07684	458 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SRN2	YLR119W	YDR061W	Q12298	539 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SRN2	YLR119W	MRPL8	P22353	238 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SRN2	YLR119W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SRN2	YLR119W	IES6	P32617	166 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SRN2	YLR119W	MID2	P36027	376 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SRN2	YLR119W	DEP1	P31385	405 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SRN2	YLR119W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SRN2	YLR119W	YIP5	P53108	310 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SRN2	YLR119W	YDL199C	Q12407	687 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SRN2	YLR119W	SPO23	P33757	523 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SRN2	YLR119W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SRN2	YLR119W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SRN2	YLR119W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SRN2	YLR119W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SRN2	YLR119W	PSK1	P31374	1356 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SRN2	YLR119W	COX4	P04037	155 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SRN2	YLR119W	STE7	P06784	515 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SRN2	YLR119W	MKC7	P53379	596 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SRN2	YLR119W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SRN2	YLR119W	ZRC1	P20107	442 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SRN2	YLR119W	GPI18	P38211	433 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SRN2	YLR119W	RXT2	P38255	430 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SRN2	YLR119W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SRN2	YLR119W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SRN2	YLR119W	PRB1	P09232	635 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRN2	YLR119W	EOS1	P53938	366 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRN2	YLR119W	VHS1	Q03785	461 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRN2	YLR119W	SKS1	Q12505	502 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRN2	YLR119W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SRN2	YLR119W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SRN2	YLR119W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SRN2	YLR119W	YHR177W	P38867	453 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRN2	YLR119W	TIM17	P39515	158 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRN2	YLR119W	SEC9	P40357	651 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRN2	YLR119W	KTR6	P54070	446 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRN2	YLR119W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SRN2	YLR119W	GIT1	P25346	518 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRN2	YLR119W	DAD2	P36162	133 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRN2	YLR119W	ABM1	P47146	123 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRN2	YLR119W	MRPS16	Q02608	121 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRN2	YLR119W	PEX27	Q08580	376 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRN2	YLR119W	HIF1	Q12373	385 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRN2	YLR119W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SRN2	YLR119W	MSP1	P28737	362 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SRN2	YLR119W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SRN2	YLR119W	MRPS9	P38120	278 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SRN2	YLR119W	BMT2	P38278	337 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SRN2	YLR119W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SRN2	YLR119W	IGD1	P43598	195 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SRN2	YLR119W	YPS5	P53057	165 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SRN2	YLR119W	MPS2	P53159	387 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SRN2	YLR119W	PSO2	P30620	661 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRN2	YLR119W	PFS1	P38872	237 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRN2	YLR119W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SRN2	YLR119W	RET3	P53600	189 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRN2	YLR119W	MSC3	Q05812	728 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRN2	YLR119W	SHS1	Q07657	551 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SRN2	YLR119W	SOL2	P37262	315 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SRN2	YLR119W	YSW1	P38280	609 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SRN2	YLR119W	VHT1	P53241	593 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SRN2	YLR119W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SRN2	YLR119W	SFM1	Q12314	213 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SRN2	YLR119W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SRN2	YLR119W	MAS2	P11914	482 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SRN2	YLR119W	LDS1	P31379	325 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SRN2	YLR119W	MSK1	P32048	576 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SRN2	YLR119W	SNL1	P40548	159 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SRN2	YLR119W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SRN2	YLR119W	MCH1	Q07376	486 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SRN2	YLR119W	HEM4	P06174	275 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SRN2	YLR119W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SRN2	YLR119W	YHR182W	P38870	785 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SRN2	YLR119W	SEO1	P39709	593 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SRN2	YLR119W	CIN2	P46670	268 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SRN2	YLR119W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SRN2	YLR119W	ECM11	Q04110	302 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SRN2	YLR119W	YPQ1	Q12010	308 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SRN2	YLR119W	YDL109C	Q12103	647 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SRN2	YLR119W	CMK2	P22517	447 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRN2	YLR119W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SRN2	YLR119W	VAM7	P32912	316 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRN2	YLR119W	YKR015C	P36111	568 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRN2	YLR119W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SRN2	YLR119W	KEG1	P43614	200 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRN2	YLR119W	YGL262W	P53054	175 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRN2	YLR119W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SRN2	YLR119W	YPL107W	Q02873	248 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRN2	YLR119W	YPR078C	Q06813	372 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRN2	YLR119W	GAT3	Q07928	141 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRN2	YLR119W	YDL012C	Q12489	107 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SRN2	YLR119W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
SRN2	YLR119W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
SRN2	YLR119W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
SRN2	YLR119W	DPH2	P32461	534 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRN2	YLR119W	PEX22	P39718	180 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRN2	YLR119W	FSH2	Q05015	223 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRN2	YLR119W	LDB17	Q12342	491 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SRN2	YLR119W	FRE6	Q12473	712 aa		4.49	□□□□□ -1.69

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