RNA–Protein interactions for RNA: YKR093W

PTR2, Transcript of Integral membrane peptide transporter, yeast

Gene PTR2, Length 1,806 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PTR2	YKR093W	RIM13	Q03792	727 aa		5	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	RAX1	Q08760	435 aa		5	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	CAP2	P13517	287 aa		5	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	CTM1	P38818	585 aa		5	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	RCY1	P39531	840 aa		5	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	YIR016W	P40572	265 aa		5	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	PIR3	Q03180	325 aa		5	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	TLG1	Q03322	224 aa		5	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	BCH1	Q05029	724 aa		5	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	YPR1	Q12458	312 aa		5	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	RSR1	P13856	272 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	SLY1	P22213	666 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	PTR2	P32901	601 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	IST2	P38250	946 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	IML3	P38265	245 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	INA22	P40576	216 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	CCE1	Q03702	353 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	SHS1	Q07657	551 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	GAT3	Q07928	141 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	YPL199C	Q08954	240 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	GPI12	P23797	304 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	PEX2	P32800	271 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	CHK1	P38147	527 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	YBR137W	P38276	179 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	SBE22	P38814	852 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	DSE1	P40077	573 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	ALG8	P40351	577 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	FMP33	P46998	180 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	LST7	P53237	242 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	YMR181C	Q03231	154 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	YLR173W	Q06247	608 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	BCP1	Q06338	283 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	MRS3	P10566	314 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	NDC1	P32500	655 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	YIL152W	P40455	235 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	XBP1	P40489	647 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	YOL107W	Q12239	342 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	GEP4	P38812	185 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	BIO3	P50277	480 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	STP1	Q00947	519 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	YMR102C	Q03177	834 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	UBX2	Q04228	584 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	BOP2	Q06150	570 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	DSE3	Q08729	430 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTR2	YKR093W	YMR262W	P38430	313 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	JLP2	P40206	208 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	TAF6	P53040	516 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	HER2	Q03557	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	RRN11	Q04712	507 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	THI7	Q05998	598 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	AHC1	Q12433	566 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	DAL2	P25335	343 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	NTG1	P31378	399 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	TRS65	P32893	560 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	MRP4	P32902	394 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	TIR2	P33890	251 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	RBD2	Q12270	262 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	SSN2	P38931	1420 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	CSM1	P25651	190 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	ATS1	P31386	333 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	PMU1	P36069	295 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	RIB5	P38145	238 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	YCH1	P42937	148 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	BIO4	P53630	237 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	HXT11	P54862	567 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	CSM3	Q04659	317 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	RTT103	Q05543	409 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	MIX23	P38162	196 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	YHK8	P38776	514 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	KEG1	P43614	200 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	RTT101	P47050	842 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	CAF40	P53829	373 aa		4.94	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.1 ms