RNA–Protein interactions for RNA: YHR064C

SSZ1, Transcript of Hsp70 protein that interacts with Zuo1p (a DnaJ homolog), yeastyeast

Gene SSZ1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSZ1YHR064C RRP4P38792 359 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C PTI1P39927 425 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C LSM5P40089 93 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YFL066CP43538 392 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C MDE1P47095 244 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YJR030CP47101 745 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C HXT16P47185 567 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C GCV1P48015 400 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C BPL1P48445 690 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C MUP1P50276 574 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YGR035CP53222 116 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C COQ6P53318 479 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C ZRG17P53735 605 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C MNT4P53745 580 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C SNZ1Q03148 297 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C PRM15Q03262 622 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C MFB1Q04922 465 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C CIA1Q05583 330 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C RRP45Q05636 305 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C BUR2Q05949 395 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C PST1Q12355 444 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C NDJ1Q12366 352 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C SRN2Q99176 213 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C MTR10Q99189 972 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C PET9P18239 318 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C AHC2P25649 128 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C SNC1P31109 117 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C GSH1P32477 678 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C PMT1P33775 817 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C APT2P36973 181 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C MNN2P38069 597 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C SCO2P38072 301 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C MCM7P38132 845 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C DBP8P38719 431 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C GIC1P38785 314 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data5.05□□□□□ -1.6not detected
SSZ1YHR064C AIM10P39965 576 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C DOT6P40059 670 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C NDE1P40215 560 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C SWM2P40342 146 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C TED1P40533 473 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C SNM1P40993 198 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C PSA1P41940 361 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C LEM3P42838 414 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C IMO32P53219 342 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C BUD9P53226 547 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C ERV29P53337 310 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YMR130WQ04223 302 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YLR224WQ05947 369 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YLR225CQ05948 407 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YLR173WQ06247 608 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C TPO3Q06451 622 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C TEN1Q07921 160 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YLR040CQ07988 224 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C FRE3Q08905 711 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YOR283WQ12040 230 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YOL107WQ12239 342 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YPR011CQ12251 326 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YLR046CQ12253 270 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YBR085C-AO43137 85 aa5.04□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C QCR7P00128 127 aa5.04□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C COX3P00420 269 aa5.04□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C SIR2P06700 562 aa5.04□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C RAD52P06778 471 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C HOP1P20050 605 aa5.04□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C PRE7P23724 241 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C GEX1P25596 615 aa5.04□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C RNP1P32385 249 aa5.04□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C HXT4P32467 576 aa5.04□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C LST4P34239 828 aa5.04□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C MOT2P34909 587 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C GEX2P36173 615 aa5.04□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YBR137WP38276 179 aa5.04□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C LSM12P38828 187 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YHR177WP38867 453 aa5.04□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C PIC2P40035 300 aa5.04□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C LAS21P40367 830 aa5.04□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C PFS2P42841 465 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C SOK2P53438 785 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C RPL6AQ02326 176 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C CTK1Q03957 528 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C SIZ1Q04195 904 aa5.04□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C ARV1Q06541 321 aa5.04□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C SUT2Q12286 268 aa5.04□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C RRP12Q12754 1228 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C PEP4P07267 405 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C MSF1P08425 469 aa5.03□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C MET2P08465 486 aa5.03□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C TY2A-LR1P0C2J4 438 aa5.03□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C TY2A-FP0CX61 438 aa5.03□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C TY2A-GR2P0CX62 438 aa5.03□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C NHP6BP11633 99 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C RPL3P14126 387 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C MTF1P14908 341 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C TY2A-CP25383 438 aa5.03□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C STE5P32917 917 aa5.03□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C LHP1P33399 275 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C EMC3P36039 253 aa5.03□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C SOL2P37262 315 aa5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.8 ms