RNA–Protein interactions for RNA: YHL009W-B

YHL009W-B, Transcript of Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes, yeastyeast

Gene YHL009W-B, Length 5,409 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL009W-BYHL009W-B YEL067CP39978 195 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B TMA108P40462 946 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B GCD10P41814 478 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B CHA4P43634 648 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B BIT61P47041 543 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B GCV1P48015 400 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B SYF2P53277 215 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B YNR071CP53757 342 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B YNL143CP53908 130 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B RPL15BP54780 204 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B REC102Q02721 264 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B YMR027WQ04371 470 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B ERB1Q04660 807 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B ALE1Q08548 619 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B LEA1Q08963 238 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B TRM11Q12463 433 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B ADH1P00330 348 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B NFT1P0CE68 1218 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B BIK1P11709 440 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B PRD1P25375 712 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B SPB1P25582 841 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B STE14P32584 239 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B RPS0AP32905 252 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B MSR1P38714 643 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B SCC4P40090 624 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B NOP2P40991 618 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B MET12P46151 657 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B AIM22P47051 409 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B FHN1P53279 174 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B MEH1Q02205 184 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B TRS31Q03337 283 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B GMC1Q04399 608 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B DCS1Q06151 350 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B RRP42Q12277 265 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B RME1P32338 300 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B CCL1P37366 393 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B MRPS9P38120 278 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B MRP21P38175 177 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B RFS1P38234 210 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B SRP72P38688 640 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B YHR182WP38870 785 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B ALG8P40351 577 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B YIL089WP40500 205 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B IST3P40565 148 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B CHS6P40955 746 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B RPS29BP41058 56 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B VTC2P43585 828 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B RRT5P43607 289 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B MRH4P53166 561 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B MTM1P53320 366 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B CPR8P53728 308 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B SIW14P53965 281 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B TAF12Q03761 539 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B SOV1Q04748 898 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B ADY4Q05955 493 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B YPR013CQ12145 317 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B YLR108CQ12259 485 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B RBD2Q12270 262 aa-0.68□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B CAP2P13517 287 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B VPS33P20795 691 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B REC107P21651 314 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B CLB1P24868 471 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B MSG5P38590 489 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B VPS8P39702 1274 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B SNF7P39929 240 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B CIN5P40917 295 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B AIP1P46680 615 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B AQR1P53943 586 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B MTD1Q02046 320 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B YPL039WQ03080 316 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B OST6Q03723 332 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B ATG26Q06321 1198 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B CTR3Q06686 241 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B LOT6Q07923 191 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B VMA4P22203 233 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B PDE1P22434 369 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B RNA15P25299 296 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B BOS1P25385 244 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B AFR1P33304 620 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B PTC1P35182 281 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B UIP5P36137 443 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B YBR016WP38216 128 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B TOM71P38825 639 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B MRX1P40050 688 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B YER084WP40057 128 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B DLD2P46681 530 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B CTK2P46962 323 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B GWT1P47026 490 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B PMT3P47190 753 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B TRF5P48561 642 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B YNR077CP53758 84 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B MET31Q03081 177 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B YMR209CQ03648 457 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B RAD34Q06665 692 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B YDL242WQ07746 117 aa-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B RRS1Q08746 203 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
YHL009W-BYHL009W-B YTM1Q12024 460 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.8 ms