RNA–Protein interactions for RNA: YDR532C

KRE28, Transcript of Subunit of a kinetochore-microtubule binding complex, yeast

Gene KRE28, Length 1,158 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KRE28	YDR532C	COX1	P00401	534 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	COR1	P07256	457 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	PEP5	P12868	1029 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	HEM15	P16622	393 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	MXR2	P25566	168 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	YCR102C	P25608	368 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	ZIP1	P31111	875 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	PHA2	P32452	334 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	PHB1	P40961	287 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	CUP9	P41817	306 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	YNL140C	P53910	189 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	RMI1	Q02685	241 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	YMR209C	Q03648	457 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	APC4	Q04601	652 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	RIF2	Q06208	395 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	FMP45	Q07651	309 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	MMT2	Q08970	484 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	RUP1	Q12242	671 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	HSP42	Q12329	375 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.07	□□□□□ -1.76	not detected
KRE28	YDR532C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	CBP4	P37267	147 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	MNN2	P38069	597 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	VPS41	P38959	992 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	GGC1	P38988	300 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	VPS52	P39904	641 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	AXL1	P40851	1208 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	NIT2	P47016	307 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	BIO4	P53630	237 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	FMP42	Q04991	504 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	PDR8	Q06149	701 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	YDL218W	Q07629	317 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	ENT4	Q07872	247 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	ADH4	P10127	382 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	PMT2	P31382	759 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	KKQ8	P36004	724 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	RRN3	P36070	627 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	BMT2	P38278	337 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	PHO89	P38361	574 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	RPS27B	P38711	82 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	AXL2	P38928	823 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	SER3	P40054	469 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	PEP8	P40335	379 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	STE24	P47154	453 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	AIF1	P52923	378 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	ROG1	P53118	685 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	MAL13	P53338	473 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	HOL1	P53389	586 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	YOR376W	Q08900	122 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	YLR053C	Q12026	108 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	HUA2	Q12134	243 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	YOR342C	Q12182	319 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	YPR064W	Q12492	139 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	TRX3	P25372	127 aa		4.05	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	SIP1	P32578	815 aa		4.05	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	SLT2	Q00772	484 aa		4.05	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	MET31	Q03081	177 aa		4.05	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	TRI1	Q05024	226 aa		4.05	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	REX4	Q08237	289 aa		4.05	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	RAX1	Q08760	435 aa		4.05	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	NUR1	Q12066	484 aa		4.05	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	YPL247C	Q12523	523 aa		4.05	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	ATP4	P05626	244 aa		4.04	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	RPO26	P20435	155 aa		4.04	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	YME1	P32795	747 aa		4.04	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	LHS1	P36016	881 aa		4.04	□□□□□ -1.76
KRE28	YDR532C	VPS51	P36116	164 aa		4.04	□□□□□ -1.76

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