RNA–Protein interactions for RNA: Q0055

AI2, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI2	Q0055	YMR209C	Q03648	457 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	ARR2	Q06597	130 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	YDL218W	Q07629	317 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	GAT3	Q07928	141 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.61	□□□□□ -1.99	not detected
AI2	Q0055	ATG34	Q12292	412 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	STE2	D6VTK4	431 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	KIN3	P22209	435 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	BNA6	P43619	295 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	GMC2	Q06201	188 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	GPN3	Q06543	272 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	YDL057W	Q07379	328 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	MFG1	Q07684	458 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	THP1	Q08231	455 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	SEY1	Q99287	776 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	FSH3	Q99369	266 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	SNF3	P10870	884 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	NAM2	P11325	894 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	MRPL6	P32904	214 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	GPX2	P38143	162 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	YBP1	P38315	674 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	GUF1	P46943	645 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	YJR149W	P47177	404 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	NIF3	P53081	288 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	GTO3	Q04806	366 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	ECM30	Q06673	1274 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	SYO1	Q07395	620 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	PAM18	Q07914	168 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	MED4	Q12343	284 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	NCB2	Q92317	146 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	YOR338W	Q99326	363 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	WHI2	P12611	486 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	YCR022C	P25620	114 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	DTR1	P38125	572 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	YGL114W	P53134	725 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	SLD5	Q03406	294 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	CCE1	Q03702	353 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	CSM3	Q04659	317 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	TAF10	Q12030	206 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	YCR102C	P25608	368 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	TOD6	P34219	525 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	HIS2	P38635	335 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	FRT2	P39734	528 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	SHO1	P40073	367 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	DSE1	P40077	573 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	TOS8	P53147	276 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	MPS1	P54199	764 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	RPN6	Q12377	434 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	HEM2	P05373	342 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	MKK1	P32490	508 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	GDS1	P41913	522 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	JAC1	P53193	184 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	TRS23	Q03784	219 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	DLT1	Q04216	342 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	DIC1	Q06143	298 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	PDR8	Q06149	701 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	PLP2	Q12017	286 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	PDR3	P33200	976 aa		2.58	□□□□□ -2
AI2	Q0055	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
AI2	Q0055	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
AI2	Q0055	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
AI2	Q0055	ECM15	P35195	104 aa		2.58	□□□□□ -2
AI2	Q0055	RIB5	P38145	238 aa		2.58	□□□□□ -2
AI2	Q0055	RTC2	P38279	296 aa		2.58	□□□□□ -2
AI2	Q0055	PHO23	P50947	330 aa		2.58	□□□□□ -2
AI2	Q0055	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
AI2	Q0055	YIP3	P53633	176 aa		2.58	□□□□□ -2
AI2	Q0055	YNL140C	P53910	189 aa		2.58	□□□□□ -2
AI2	Q0055	YPL014W	Q02606	381 aa		2.58	□□□□□ -2
AI2	Q0055	IRC4	Q03036	179 aa		2.58	□□□□□ -2
AI2	Q0055	SCS7	Q03529	384 aa		2.58	□□□□□ -2
AI2	Q0055	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
AI2	Q0055	ARO10	Q06408	635 aa		2.58	□□□□□ -2
AI2	Q0055	LDS2	Q08218	356 aa		2.58	□□□□□ -2
AI2	Q0055	REX4	Q08237	289 aa		2.58	□□□□□ -2
AI2	Q0055	CSM4	Q08955	156 aa		2.58	□□□□□ -2

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