RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W YLR173WQ06247 608 aa9.77□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W TPO3Q06451 622 aa9.77□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W FRE3Q08905 711 aa9.77□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W FRE5Q08908 694 aa9.77□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W ICL2Q12031 575 aa9.77□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W YOL107WQ12239 342 aa9.77□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W MOD5P07884 428 aa9.76□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W NAR1P23503 491 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W HXT2P23585 541 aa9.76□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W SGE1P33335 543 aa9.76□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W SNU114P36048 1008 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W ZTA1P38230 334 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W LSM5P40089 93 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W TIR3P40552 269 aa9.76□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W PFS2P42841 465 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W YJR149WP47177 404 aa9.76□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W GCV1P48015 400 aa9.76□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W ATH1P48016 1211 aa9.76□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W PRM15Q03262 622 aa9.76□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W SIZ1Q04195 904 aa9.76□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W ARG7Q04728 441 aa9.76□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W YLR040CQ07988 224 aa9.76□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W NDJ1Q12366 352 aa9.76□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W LEU4P06208 619 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W MRP2P10663 115 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W RPL3P14126 387 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W APA1P16550 321 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W PHO80P20052 293 aa9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W MNE1P24720 663 aa9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W YCR102CP25608 368 aa9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W YIM1P28625 365 aa9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W HXT4P32467 576 aa9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W YJR030CP47101 745 aa9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W YJR107WP47145 328 aa9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W SCY1P53009 804 aa9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W AIM14P53109 570 aa9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W MPS2P53159 387 aa9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W HST3P53687 447 aa9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W FRE4P53746 719 aa9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W YNL034WP53963 612 aa9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W CTK1Q03957 528 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W YML083CQ04526 418 aa9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W CIA1Q05583 330 aa9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W TEN1Q07921 160 aa9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W YLR036CQ07986 203 aa9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W YLR046CQ12253 270 aa9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W YOR338WQ99326 363 aa9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W COX3P00420 269 aa9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W BAR1P12630 587 aa9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W CMP2P14747 604 aa9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W SPS19P32573 292 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W EMC3P36039 253 aa9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W SOL2P37262 315 aa9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W STP2P38704 541 aa9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W QDR2P40474 542 aa9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W FMC1P40491 155 aa9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W TED1P40533 473 aa9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W AAD10P47182 288 aa9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W RTS3P53289 263 aa9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W PLB2Q03674 706 aa9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W MSS11Q03825 758 aa9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W GAD1Q04792 585 aa9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W RTN1Q04947 295 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W BSC1Q12140 328 aa9.75□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W PRE7P23724 241 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W PEX1P24004 1043 aa9.74□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W CTS1P29029 562 aa9.74□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W KRE6P32486 720 aa9.74□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W MTC2P34246 357 aa9.74□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W ASC1P38011 319 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W APL3P38065 1025 aa9.74□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W PCL5P38794 229 aa9.74□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W YHR177WP38867 453 aa9.74□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W PAC10P48363 199 aa9.74□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W JAC1P53193 184 aa9.74□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W TPS1Q00764 495 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W SPP1Q03012 353 aa9.74□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W RNH202Q05635 350 aa9.74□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W DCS1Q06151 350 aa9.74□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W MLC2Q06580 163 aa9.74□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W MRPL35Q06678 367 aa9.74□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W YOR387CQ08910 206 aa9.74□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W RGT2Q12300 763 aa9.74□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W YOL114CQ12322 202 aa9.74□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W APC2Q12440 853 aa9.74□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W IPP1P00817 287 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W PUP1P25043 261 aa9.73□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W CNB1P25296 175 aa9.73□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W GEX1P25596 615 aa9.73□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W AHC2P25649 128 aa9.73□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W TMA19P35691 167 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W CBT1P36038 271 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W IRS4P36115 615 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W GEX2P36173 615 aa9.73□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W YRO2P38079 344 aa9.73□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W SHE1P38200 338 aa9.73□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W MBP1P39678 833 aa9.73□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W YEL073CP39974 107 aa9.73□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W SWM2P40342 146 aa9.73□□□□□ -0.85
PRP4YPR178W YIR016WP40572 265 aa9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.1 ms