RNA–Protein interactions for RNA: YPL079W

RPL21B, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L21B, yeast

Gene RPL21B, Length 483 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPL21B	YPL079W	MOD5	P07884	428 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	GAL7	P08431	366 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	NPR1	P22211	790 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	RAD51	P25454	400 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	RPC82	P32349	654 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	PTR2	P32901	601 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	SEC61	P32915	480 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	NUF2	P33895	451 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	SRX1	P36077	127 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	SRO77	P38163	1010 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	RTC2	P38279	296 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	SBE22	P38814	852 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	CTF8	P38877	133 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	YHR219W	P38900	624 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	IES5	P40060	125 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	YGR168C	P53293	376 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	YKR005C	Q02203	525 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	KRE28	Q04431	385 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	YFT2	Q06676	274 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	SIA1	Q12212	622 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	RBD2	Q12270	262 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	OAC1	P32332	324 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	NDC1	P32500	655 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	DOM34	P33309	386 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	SKN1	P33336	771 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	BAP2	P38084	609 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	YAL037W	P39728	267 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	GID8	P40208	455 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	SNM1	P40993	198 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	IRC6	P43615	237 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	RET2	P43621	546 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	SSY5	P47002	699 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	ATF2	P53296	535 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	ASI1	P54074	624 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	YDR541C	Q03049	344 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	SRL4	Q03085	281 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	MGR3	Q04472	501 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	GAL83	Q04739	417 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	BRE4	Q07660	1125 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	DIN7	Q12086	430 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	YOL107W	Q12239	342 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	SFM1	Q12314	213 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	MGR1	P25573	417 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	YCR100C	P25606	316 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	BUB3	P26449	341 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	PRO1	P32264	428 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	YKL077W	P36081	392 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	OMA1	P36163	345 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	FES1	P38260	290 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	EHT1	P38295	451 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	ECM34	P38728	170 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	YLF2	P38746	405 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	MNL1	P38888	796 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	GIP2	P40036	548 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	MET28	P40573	187 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	STB1	P42845	420 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	MRPS18	P42847	217 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	ROM1	P53046	1155 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	MAL11	P53048	616 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	SUN4	P53616	420 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	CPR8	P53728	308 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	SWS2	P53937	143 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	NIS1	P53939	407 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	SNZ1	Q03148	297 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	TFB3	Q03290	321 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	INP1	Q03694	420 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	MDM36	Q06820	579 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	SOG2	Q08817	791 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	FRE5	Q08908	694 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	RCN2	Q12044	265 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	PUS9	Q12069	462 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	PNS1	Q12412	539 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	YOR019W	Q99248	730 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	MDM35	O60200	86 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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