RNA–Protein interactions for RNA: YOR113W

AZF1, Transcript of Zinc-finger transcription factor, yeast

Gene AZF1, Length 2,745 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AZF1	YOR113W	YOL107W	Q12239	342 aa		1.25	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	AHC1	Q12433	566 aa		1.25	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	1.24	□□□□□ -2.21	not detected
AZF1	YOR113W	YLL053C	P0CD98	152 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	RPB8	P20436	146 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	GPI12	P23797	304 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	ADY2	P25613	283 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	CWP1	P28319	239 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	HOT13	P36078	116 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	PHD1	P36093	366 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	YHR045W	P38775	560 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	ATG7	P38862	630 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	PRM9	P39551	298 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	CSM2	P40465	213 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	SNL1	P40548	159 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	YCH1	P42937	148 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	IRC7	P43623	340 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	LOH1	P47055	219 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	HMS2	P47175	358 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	PHB2	P50085	310 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	NAS6	P50086	228 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	BIO4	P53630	237 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	YNL260C	P53846	198 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	SAM50	P53969	484 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	SMP3	Q04174	516 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	NAT4	Q04751	285 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	COX20	Q04935	205 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	YOL075C	Q08234	1294 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	NRT1	Q08485	598 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	RRI1	Q12468	440 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	YOR338W	Q99326	363 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	SAC3	P46674	1301 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	MBR1	P23493	339 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	LSB5	P25369	354 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	YCR022C	P25620	114 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	COQ3	P27680	312 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	1.24	□□□□□ -2.21	not detected
AZF1	YOR113W	FRE2	P36033	711 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	COS9	P36034	407 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	YCR041W	P37265	110 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	STV1	P37296	890 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	IST2	P38250	946 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	APD1	P38281	316 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	1.24	□□□□□ -2.21	not detected
AZF1	YOR113W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	OTU1	P43558	301 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	YNR048W	P53740	393 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	FRE4	P53746	719 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	KTR6	P54070	446 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	PET117	Q02771	107 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	BCP1	Q06338	283 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	CTS2	Q06350	511 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	GIS3	Q12418	502 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	SAL1	D6W196	494 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	RPN13	O13563	156 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	CLN3	P13365	580 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	SUA5	P32579	426 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	ECM15	P35195	104 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	MYO3	P36006	1272 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	YKR015C	P36111	568 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	CBP4	P37267	147 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	GPX2	P38143	162 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	VPS52	P39904	641 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	DSE1	P40077	573 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	RTS2	P40962	232 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	RRT5	P43607	289 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	YJL118W	P47022	219 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	SPP2	Q02521	185 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	PNG1	Q02890	363 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	RSC9	Q03124	581 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	SNZ1	Q03148	297 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	IZH1	Q03419	316 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	RSN1	Q03516	953 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AZF1	YOR113W	UBX2	Q04228	584 aa		1.24	□□□□□ -2.21

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