RNA–Protein interactions for RNA: YOL093W

TRM10, Transcript of tRNA methyltransferase, yeast

Gene TRM10, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRM10	YOL093W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	SKN1	P33336	771 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	NUF2	P33895	451 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	YBR241C	P38142	488 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	YHR218W	P38899	603 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	RIP-Chip
TRM10	YOL093W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	LRO1	P40345	661 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	YFR020W	P43600	232 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	MUP1	P50276	574 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	RTS3	P53289	263 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	YML096W	Q04489	525 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	YEH1	Q07804	573 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	IRC13	Q08630	104 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	VIK1	Q12045	647 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	SFM1	Q12314	213 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	PSY3	Q12318	242 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	MHT1	Q12525	324 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	MDM12	Q92328	271 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	FMP27	Q06179	2628 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	RAP1	P11938	827 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	YAK1	P14680	807 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	CMK2	P22517	447 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	DMC1	P25453	334 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	NTH1	P32356	751 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	SPC34	P36131	295 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	CTF8	P38877	133 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	ERV46	P39727	415 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	YJL068C	P40363	299 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	SNL1	P40548	159 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	PAC11	P40960	533 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	PTR3	P43606	678 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	YJL043W	P47053	257 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	RAD17	P48581	401 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	SPO19	Q03029	223 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	APC4	Q04601	652 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	ASA1	Q06822	443 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	MFG1	Q07684	458 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	SWM1	Q12379	170 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	YPR064W	Q12492	139 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	MHF2	Q3E829	80 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	YPR096C	O13587	100 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	UGA1	P17649	471 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	URA4	P20051	364 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	MGR1	P25573	417 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	DOA1	P36037	715 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	BNA4	P38169	460 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	RCK1	P38622	512 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	RBG1	P39729	369 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	LTP1	P40347	161 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	PRM10	P42946	383 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	CIS3	P47001	227 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	PAC10	P48363	199 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	RMR1	P53060	241 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	OAZ1	Q02803	292 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	DIC1	Q06143	298 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	YLR030W	Q07967	263 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	RRT8	Q08219	342 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	THP1	Q08231	455 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	ENV7	Q12003	364 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	MLH3	Q12083	715 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	YOL107W	Q12239	342 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	YDL199C	Q12407	687 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	LAS17	Q12446	633 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	PUT2	P07275	575 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	GAL7	P08431	366 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	GAL3	P13045	520 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	FAR1	P21268	830 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	RPD3	P32561	433 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	AST1	P35183	429 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	TAF14	P35189	244 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	VPS51	P36116	164 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRM10	YOL093W	SKG1	P36169	355 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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