RNA–Protein interactions for RNA: YOL077C

BRX1, Transcript of Nucleolar protein, yeast

Gene BRX1, Length 876 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BRX1	YOL077C	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	ATM1	P40416	690 aa		2.7	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.7	□□□□□ -1.98	not detected
BRX1	YOL077C	BNS1	P50084	137 aa		2.7	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	ROG1	P53118	685 aa		2.7	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	MKC7	P53379	596 aa		2.7	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	YET2	Q04210	160 aa		2.7	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	GYL1	Q04322	720 aa		2.7	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	NSE1	Q07913	336 aa		2.7	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	UAF30	Q08747	228 aa		2.7	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	GPM3	Q12326	303 aa		2.7	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	NAG1	Q8TGN9	163 aa		2.7	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	PSK1	P31374	1356 aa		2.7	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.69	□□□□□ -1.98	not detected
BRX1	YOL077C	TPK3	P05986	398 aa		2.69	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	CDC50	P25656	391 aa		2.69	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	DOA1	P36037	715 aa		2.69	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	GPI16	P38875	610 aa		2.69	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	ATG18	P43601	500 aa		2.69	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	COX4	P04037	155 aa		2.68	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	QDR3	P38227	689 aa		2.68	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	YPR091C	Q06833	770 aa		2.68	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	YOP1	Q12402	180 aa		2.68	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	OPI3	P05375	206 aa		2.67	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	YSC83	P32792	385 aa		2.67	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	ECM8	P38246	354 aa		2.67	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	OM14	P38325	134 aa		2.67	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	YER186C	P40101	306 aa		2.67	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	PAC11	P40960	533 aa		2.67	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	STE24	P47154	453 aa		2.67	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	YML6	P51998	286 aa		2.67	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	COS1	P53822	381 aa		2.67	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	MRPS16	Q02608	121 aa		2.67	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	VHS1	Q03785	461 aa		2.67	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	FCY22	Q12119	530 aa		2.67	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	RPL12B	P0CX54	165 aa		2.66	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	YDR541C	Q03049	344 aa		2.66	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	YMR010W	Q03687	405 aa		2.66	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	ECM7	Q06200	448 aa		2.66	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	YDL114W	Q07530	308 aa		2.66	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	MFG1	Q07684	458 aa		2.66	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	RNH203	Q12338	110 aa		2.66	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	PCL9	Q12477	304 aa		2.66	□□□□□ -1.98
BRX1	YOL077C	MRPS9	P38120	278 aa		2.65	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	GPX2	P38143	162 aa		2.65	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	GPI18	P38211	433 aa		2.65	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	GEP4	P38812	185 aa		2.65	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	YJL055W	P47044	245 aa		2.65	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	KTR6	P54070	446 aa		2.65	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	2.65	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	ERO1	Q03103	563 aa		2.65	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	ASA1	Q06822	443 aa		2.65	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	2.65	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	YPQ1	Q12010	308 aa		2.65	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	2.65	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	ZRC1	P20107	442 aa		2.64	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	DEP1	P31385	405 aa		2.64	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	PFS1	P38872	237 aa		2.64	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	TIM17	P39515	158 aa		2.64	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	YPS5	P53057	165 aa		2.64	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	URC2	Q04411	772 aa		2.64	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	NDL1	Q06568	189 aa		2.64	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	MCH1	Q07376	486 aa		2.64	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	AAD15	Q08361	143 aa		2.64	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	HMS1	Q12398	434 aa		2.64	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	YDL012C	Q12489	107 aa		2.64	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	PRB1	P09232	635 aa		2.63	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	FUN26	P31381	517 aa		2.63	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	TIR2	P33890	251 aa		2.63	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	MNL1	P38888	796 aa		2.63	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	SEO1	P39709	593 aa		2.63	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	LCB2	P40970	561 aa		2.63	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	IGD1	P43598	195 aa		2.63	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	TOS2	P50078	622 aa		2.63	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	PMT5	P52867	743 aa		2.63	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	YGL262W	P53054	175 aa		2.63	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	RTT102	P53330	157 aa		2.63	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	VPS9	P54787	451 aa		2.63	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	MEH1	Q02205	184 aa		2.63	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	ECM11	Q04110	302 aa		2.63	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	LDS2	Q08218	356 aa		2.63	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	YDL199C	Q12407	687 aa		2.63	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	RRN9	P53437	365 aa		2.62	□□□□□ -1.99
BRX1	YOL077C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.3 ms