RNA–Protein interactions for RNA: YOL072W

THP1, Transcript of Nuclear pore-associated protein, yeast

Gene THP1, Length 1,368 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
THP1	YOL072W	SFA1	P32771	386 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	HCS1	P34243	683 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	YKR015C	P36111	568 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	BIG1	P38813	335 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	MTG2	P38860	518 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	ELO1	P39540	310 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	CIS3	P47001	227 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	GPI8	P49018	411 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	SLD3	P53135	668 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	PRM8	P53174	237 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	YGR079W	P53249	370 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	FHN1	P53279	174 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	SNF12	P53628	566 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	SWS2	P53937	143 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	SWP1	Q02795	286 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	YPL107W	Q02873	248 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	RSC9	Q03124	581 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	TRM82	Q03774	444 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	MMT2	Q08970	484 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	RIB3	Q99258	208 aa		4.76	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	MET17	P06106	444 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	VPS33	P20795	691 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	HCM1	P25364	564 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	RHB1	P25378	209 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	MGR1	P25573	417 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	BUB3	P26449	341 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	YIM1	P28625	365 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	PRO1	P32264	428 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	NTH1	P32356	751 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	PET112	P33893	541 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	TUL1	P36096	758 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	ECM4	P36156	370 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	ATG14	P38270	344 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	SPO73	P40031	143 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	LRO1	P40345	661 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	YGR201C	P42936	225 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	CDH1	P53197	566 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	TLG1	Q03322	224 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	THI73	Q07904	523 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	MED7	Q08278	222 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	PUS9	Q12069	462 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	SFM1	Q12314	213 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	MRX4	Q12467	430 aa		4.75	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	GAL7	P08431	366 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	NPR1	P22211	790 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.74	□□□□□ -1.65	not detected
THP1	YOL072W	RPC82	P32349	654 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	SKN1	P33336	771 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	YHR112C	P38716	378 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	GOS1	P38736	223 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	SOK1	P40317	901 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	YJL068C	P40363	299 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	TWF1	P53250	332 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	SUN4	P53616	420 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	RHO4	Q00246	291 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	SED5	Q01590	340 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	GRX5	Q02784	150 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	RIM13	Q03792	727 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	YML053C	Q04978	212 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	XYL2	Q07993	356 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	YOL107W	Q12239	342 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	GLO4	Q12320	285 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	YDR262W	Q12331	272 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	LAG2	Q92325	660 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	MED11	Q99278	115 aa		4.74	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	SIR3	P06701	978 aa		4.73	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	SAC7	P17121	654 aa		4.73	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	PTP1	P25044	335 aa		4.73	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	RNQ1	P25367	405 aa		4.73	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	COQ2	P32378	372 aa		4.73	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
THP1	YOL072W	LOT5	P34234	306 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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