RNA–Protein interactions for RNA: YNL171C

YNL171C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL171C, Length 369 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL171C	YNL171C	AHC1	Q12433	566 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.45	□□□□□ -1.86	not detected
YNL171C	YNL171C	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	MSI1	P13712	422 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	PUP2	P32379	260 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	YFR057W	P43625	151 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	PMT5	P52867	743 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	MLC1	P53141	149 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	YMR027W	Q04371	470 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	RIF2	Q06208	395 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	IPK1	Q06667	281 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	AAD15	Q08361	143 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	YDR061W	Q12298	539 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	JID1	Q12350	301 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	YOP1	Q12402	180 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	IZH2	Q12442	317 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	SRN2	Q99176	213 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	MRPL4	P36517	319 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	SHY1	P53266	389 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	COS1	P53822	381 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	TDA1	Q03533	586 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	PRM6	Q04705	352 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	ASA1	Q06822	443 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	YHK8	P38776	514 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	BIR1	P47134	954 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	TOS2	P50078	622 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	MST27	P53176	234 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	EOS1	P53938	366 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	MHR1	Q06630	226 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	LDS2	Q08218	356 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	PLP2	Q12017	286 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	RPB5	P20434	215 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	BLI1	P35727	113 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	GPX2	P38143	162 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	GEP4	P38812	185 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	ADD37	Q03233	198 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	YFH1	Q07540	174 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	PRR1	P28708	518 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	SPT10	P35208	640 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	RTC2	P38279	296 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	RRN9	P53437	365 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	FRE6	Q12473	712 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	NUP2	P32499	720 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	SWI3	P32591	825 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	SPR1	P32603	445 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	TIR2	P33890	251 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	YBL028C	P38202	106 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	ECM8	P38246	354 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	YHR177W	P38867	453 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	MIG3	P39943	394 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	GAB1	P41733	394 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	EGT2	P42835	1041 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	TIS11	P47977	285 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	CLD1	P53264	445 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	CRH1	P53301	507 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	YLR152C	P54072	576 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	SKS1	Q12505	502 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	MSP1	P28737	362 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	DPH2	P32461	534 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	HXT1	P32465	570 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	DAD2	P36162	133 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	YSW1	P38280	609 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	OXA1	P39952	402 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	YPL107W	Q02873	248 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	YPR091C	Q06833	770 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	FCY22	Q12119	530 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	TOA2	P32774	122 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	APE4	P38821	490 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	DFG10	P40526	253 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	BNS1	P50084	137 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	LIP2	Q06005	328 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	PCL9	Q12477	304 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	NAG1	Q8TGN9	163 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	ATG18	P43601	500 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	HAL1	Q01766	294 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	YDL114W	Q07530	308 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	PEX27	Q08580	376 aa		3.37	□□□□□ -1.87

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.1 ms