RNA–Protein interactions for RNA: YMR032W

HOF1, Transcript of SH3 domain-containing protein required for cytokinesis, yeast

Gene HOF1, Length 2,010 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HOF1	YMR032W	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	QCR7	P00128	127 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	HTB2	P02294	131 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	MAS2	P11914	482 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	PCT1	P13259	424 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	DAL82	P21705	255 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	YOX1	P34161	385 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	LHS1	P36016	881 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	YKL162C	P36052	402 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	MRPL7	P36519	292 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	ICS2	P38284	255 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	HIS2	P38635	335 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	STP2	P38704	541 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	PAC11	P40960	533 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	PTR3	P43606	678 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	GIS1	Q03833	894 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	TEN1	Q07921	160 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HOF1	YMR032W	SCEI	P03882	235 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
HOF1	YMR032W	RPO26	P20435	155 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	ACH1	P32316	526 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	RPH1	P39956	796 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	GAT2	P40209	560 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	YFR020W	P43600	232 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	RPC17	P47076	161 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	CTH1	P47976	325 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	YNR014W	P53719	212 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	HPF1	Q05164	967 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	YDL144C	Q07589	356 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	DDC1	Q08949	612 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	COR1	P07256	457 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	ELM1	P32801	640 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	ECM10	P39987	644 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	SOK1	P40317	901 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	COA1	P40452	197 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	POG1	P40473	351 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	IRC7	P43623	340 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	MPS1	P54199	764 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	ROT1	Q03691	256 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	IZH3	Q07959	543 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	QCR2	P07257	368 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	YMR31	P19955	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	MSK1	P32048	576 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	RRN10	P38204	145 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	SNX4	P47057	423 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	VPS62	P53285	467 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	KRE28	Q04431	385 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	SNF8	Q12483	233 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	ECM5	Q03214	1411 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	RHO2	P06781	192 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	POX1	P13711	748 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	SNA3	P14359	133 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	REC114	P32841	428 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	HES1	P35843	434 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	VMA22	P38784	181 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	YJR056C	P47115	236 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	GET1	P53192	235 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	YGR168C	P53293	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	IRC4	Q03036	179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	SOR2	Q07786	357 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	FSH3	Q99369	266 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	HMT1	P38074	348 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	INM1	P38710	295 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	LNP1	P38878	278 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	ICP55	P40051	511 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	ZRG17	P53735	605 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	RNH203	Q12338	110 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	CLN3	P13365	580 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	CNA1	P23287	553 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	KAR4	P25583	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	CNE1	P27825	502 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	PDR3	P33200	976 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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