RNA–Protein interactions for RNA: YJL178C

ATG27, Transcript of Type I membrane protein involved in autophagy and the Cvt pathway, yeast

Gene ATG27, Length 816 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG27	YJL178C	PHO86	P46956	311 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	RPC17	P47076	161 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	POP6	P53218	158 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	YMR155W	Q03795	547 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	BI3	Q9ZZW7	517 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	HIP1	P06775	603 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	SPS4	P09937	338 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	MAS2	P11914	482 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	DEP1	P31385	405 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	SWI3	P32591	825 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	MRP4	P32902	394 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	YCR041W	P37265	110 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	CBP4	P37267	147 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	MSG5	P38590	489 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	COS5	P47187	383 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	SHE10	P53075	577 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	PCP1	P53259	346 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	YGR111W	P53265	400 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	RRN11	Q04712	507 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	TAF9	Q05027	157 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	STE23	Q06010	1027 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	SHS1	Q07657	551 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	SMC5	Q08204	1093 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	CLB1	P24868	471 aa		3	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	DBF4	P32325	704 aa		3	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	RML2	P32611	393 aa		3	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	NFU1	P32860	256 aa		3	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	MMS21	P38632	267 aa		3	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	YDR387C	Q04162	555 aa		3	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	VTA1	Q06263	330 aa		3	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	CDD1	Q06549	142 aa		3	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	RIP1	P08067	215 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	YAR066W	P0CX18	203 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	YHR214W	P0CX19	203 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	ASP3-2	P0CX77	362 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	ASP3-3	P0CX78	362 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	ASP3-4	P0CX79	362 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	POX1	P13711	748 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	HEM15	P16622	393 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	PRR1	P28708	518 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	NPL6	P32832	435 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	YBR062C	P38239	180 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	MED8	P38304	223 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	VHC1	P38329	1120 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	YMR134W	P40207	237 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	YIL067C	P40514	678 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	SRB7	P47822	140 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	YIP1	P53039	248 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	GOR1	P53839	350 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	PNG1	Q02890	363 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	ECM7	Q06200	448 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	YPL199C	Q08954	240 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	EMP46	Q12396	444 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	GIS3	Q12418	502 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	SEC63	P14906	663 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	CLB3	P24870	427 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	YCR051W	P25631	222 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	MGT1	P26188	188 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	DPH2	P32461	534 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.98	□□□□□ -1.93	not detected
ATG27	YJL178C	YBL059W	P34224	193 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	HCS1	P34243	683 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ATG27	YJL178C	YBR032W	P38223	100 aa		2.98	□□□□□ -1.93

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