RNA–Protein interactions for RNA: YJL013C

MAD3, Transcript of Subunit of spindle-assembly checkpoint complex, yeast

Gene MAD3, Length 1,548 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MAD3	YJL013C	YOR338W	Q99326	363 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	MRPL8	P22353	238 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	PTP1	P25044	335 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	NDC1	P32500	655 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	TOA2	P32774	122 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	SIM1	P40472	476 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	PCI8	P40512	444 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	RRT5	P43607	289 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	AZR1	P50080	613 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	SLY1	P22213	666 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	CIN8	P27895	1000 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	BUD2	P33314	1104 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	YKL070W	P36087	169 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	MRPL37	P36532	105 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	YMR134W	P40207	237 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	SFH5	P47008	294 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	GTO1	P48239	356 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	YDL186W	P48568	277 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	SHE10	P53075	577 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	RPM2	Q02773	1202 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	CCE1	Q03702	353 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	ERV41	Q04651	352 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	POM152	P39685	1337 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	YCL068C	P25593	260 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	RIB5	P38145	238 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	SEC9	P40357	651 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	YIL152W	P40455	235 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	RRN9	P53437	365 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	YMR181C	Q03231	154 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	APC4	Q04601	652 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	FMP42	Q04991	504 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	YLR281C	Q05863	155 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	BUR2	Q05949	395 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	APC5	Q08683	685 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	MXR2	P25566	168 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	YEF1	P32622	495 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	BZZ1	P38822	633 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	SPT8	P38915	602 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	FAA2	P39518	744 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	LOH1	P47055	219 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	YGL185C	P53100	379 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	MND1	P53102	219 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	CAF40	P53829	373 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	NAT4	Q04751	285 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	RRT8	Q08219	342 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
MAD3	YJL013C	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	CAP2	P13517	287 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	YUR1	P26725	428 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	VAM7	P32912	316 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	PMU1	P36069	295 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	CHK1	P38147	527 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	RTT101	P47050	842 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	BCH1	Q05029	724 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	SHS1	Q07657	551 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	ATR1	P13090	542 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	IME2	P32581	645 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	MRPS5	P33759	307 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	ASK1	P35734	292 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	GEP4	P38812	185 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	CSI1	Q04368	295 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	RNH1	Q04740	348 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	RAX1	Q08760	435 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MAD3	YJL013C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MAD3	YJL013C	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MAD3	YJL013C	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MAD3	YJL013C	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MAD3	YJL013C	RPC25	P35718	212 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MAD3	YJL013C	MYO3	P36006	1272 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MAD3	YJL013C	FET3	P38993	636 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MAD3	YJL013C	MET30	P39014	640 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MAD3	YJL013C	YIL169C	P40442	995 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MAD3	YJL013C	NUP84	P52891	726 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MAD3	YJL013C	YGR168C	P53293	376 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MAD3	YJL013C	YGR266W	P53326	701 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MAD3	YJL013C	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69

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