RNA–Protein interactions for RNA: YHR153C

SPO16, Transcript of Meiosis-specific protein involved in synaptonemal complex assembly, yeast

Gene SPO16, Length 597 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPO16	YHR153C	EFM4	P40516	257 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SPO16	YHR153C	SPG5	P42933	373 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SPO16	YHR153C	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SPO16	YHR153C	PEX25	Q02969	394 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SPO16	YHR153C	SRN2	Q99176	213 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SPO16	YHR153C	YOR1	P53049	1477 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SPO16	YHR153C	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SPO16	YHR153C	PET123	P17558	318 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SPO16	YHR153C	NAM9	P27929	486 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SPO16	YHR153C	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.17	□□□□□ -1.74	not detected
SPO16	YHR153C	COX13	P32799	129 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SPO16	YHR153C	MNS1	P32906	549 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SPO16	YHR153C	CHK1	P38147	527 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SPO16	YHR153C	COX14	P39103	70 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SPO16	YHR153C	MLC1	P53141	149 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SPO16	YHR153C	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SPO16	YHR153C	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SPO16	YHR153C	NCA2	Q12374	616 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SPO16	YHR153C	POL1	P13382	1468 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SPO16	YHR153C	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SPO16	YHR153C	MLP2	P40457	1679 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SPO16	YHR153C	PDR12	Q02785	1511 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SPO16	YHR153C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SPO16	YHR153C	POP5	P28005	173 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SPO16	YHR153C	SKN1	P33336	771 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SPO16	YHR153C	SKT5	P34226	696 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SPO16	YHR153C	RXT2	P38255	430 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SPO16	YHR153C	GPI16	P38875	610 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SPO16	YHR153C	TOS3	P43637	560 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SPO16	YHR153C	ALF1	P53904	254 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SPO16	YHR153C	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	KAR9	P32526	644 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	YIL029C	P40538	142 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	MDE1	P47095	244 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	ROG1	P53118	685 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	MTM1	P53320	366 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	MTQ1	P53944	314 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	CCE1	Q03702	353 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	MDM36	Q06820	579 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	LOT6	Q07923	191 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	AAD15	Q08361	143 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	SKS1	Q12505	502 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	TY3B-G	Q99315	1547 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	QDR3	P38227	689 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	MLH1	P38920	769 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	PAN6	P40459	309 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	EOS1	P53938	366 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	TMS1	Q12116	473 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	STH1	P32597	1359 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.13	□□□□□ -1.75	not detected
SPO16	YHR153C	CYC3	P06182	269 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	SWI3	P32591	825 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	YEF1	P32622	495 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	WSS1	P38838	269 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	SIM1	P40472	476 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	YGR117C	P53270	476 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	RTT102	P53330	157 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	IRC25	Q07951	179 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	YRM1	Q12340	786 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	PHA2	P32452	334 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	YSC83	P32792	385 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	DOA1	P36037	715 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	MRPL4	P36517	319 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	PFF1	P38244	976 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	MSG5	P38590	489 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	STP2	P38704	541 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	APE4	P38821	490 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	ATM1	P40416	690 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	CHS6	P40955	746 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	EPL1	P43572	832 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	STE24	P47154	453 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	MEH1	Q02205	184 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	URC2	Q04411	772 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	IPK1	Q06667	281 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	MRPL35	Q06678	367 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	YFH1	Q07540	174 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	FDH1	Q08911	376 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	YDR061W	Q12298	539 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	RNH203	Q12338	110 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	POM152	P39685	1337 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	STU1	P38198	1513 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	CAP2	P13517	287 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	DAD2	P36162	133 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	MAM33	P40513	266 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	SDT1	P53078	280 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	NUP116	Q02630	1113 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	PRM6	Q04705	352 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPO16	YHR153C	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75

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