RNA–Protein interactions for RNA: YHR064C

SSZ1, Transcript of Hsp70 protein that interacts with Zuo1p (a DnaJ homolog), yeastyeast

Gene SSZ1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSZ1YHR064C CTS1P29029 562 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C SPO23P33757 523 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C ANR2P36090 516 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YKR051WP36142 418 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C GLY1P37303 387 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C SIF2P38262 535 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C BIG1P38813 335 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C SSN3P39073 555 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C RCY1P39531 840 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C UFE1P41834 346 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YJL043WP47053 257 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C EXG2P52911 562 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C MPS2P53159 387 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C DBP6P53734 629 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C OAZ1Q02803 292 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C HEH2Q03281 663 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C GCN5Q03330 439 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C HER2Q03557 464 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C CCE1Q03702 353 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YMR087WQ04299 284 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C RRG7Q08774 242 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C ENV7Q12003 364 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C LPX1Q12405 387 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C SKM1Q12469 655 aa5.08□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C PHO5P00635 467 aa5.07□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C SPS2P08459 502 aa5.07□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C APA1P16550 321 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C DAL81P21657 970 aa5.07□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C MNE1P24720 663 aa5.07□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C SYP1P25623 870 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C CAM1P29547 415 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C MSS1P32559 526 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YPT7P32939 208 aa5.07□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C SUR1P33300 382 aa5.07□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C SGE1P33335 543 aa5.07□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C TEF4P36008 412 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C MRPL3P36516 390 aa5.07□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C CTF8P38877 133 aa5.07□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C TVP23P38962 199 aa5.07□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C ZRG8P40021 1076 aa5.07□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C ERG10P41338 398 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YFR018CP43599 363 aa5.07□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C CHA4P43634 648 aa5.07□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C ECM27P47144 725 aa5.07□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C GNP1P48813 663 aa5.07□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C UBC12P52491 188 aa5.07□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C FDC1Q03034 503 aa5.07□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C NGL2Q03264 515 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C ARG7Q04728 441 aa5.07□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C CLP1Q08685 445 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C FEX2Q08991 375 aa5.07□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YTM1Q12024 460 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YPL245WQ12179 454 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C RPC40P07703 335 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C MER1P16523 270 aa5.06□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C NDC1P32500 655 aa5.06□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C PET309P32522 965 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C SPS19P32573 292 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C RPS0AP32905 252 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C IFA38P38286 347 aa5.06□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C AIM46P38885 310 aa5.06□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C GDI1P39958 451 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C VRG4P40107 337 aa5.06□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C BTT1P40314 149 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C ATG18P43601 500 aa5.06□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YJR149WP47177 404 aa5.06□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C AMA1P50082 593 aa5.06□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C AIM14P53109 570 aa5.06□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YGR015CP53208 328 aa5.06□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C POP6P53218 158 aa5.06□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C BUD17P53727 317 aa5.06□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YNL165WP53891 406 aa5.06□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C HXT11P54862 567 aa5.06□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C GIP3Q03016 1276 aa5.06□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YPL034WQ03083 165 aa5.06□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C RIM13Q03792 727 aa5.06□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C DLT1Q04216 342 aa5.06□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C COX20Q04935 205 aa5.06□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C RTN1Q04947 295 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YPR114WQ06107 315 aa5.06□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C MRL1Q06815 381 aa5.06□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YDL109CQ12103 647 aa5.06□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YHR213W-AQ8TGT4 77 aa5.06□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YEL009C-AA0A023PZF2 135 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C FUM1P08417 488 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C DSF1P0CX08 502 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YNR073CP0CX09 502 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C PHO80P20052 293 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C ERG9P29704 444 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C HOM6P31116 359 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C KRE6P32486 720 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C PET127P32606 800 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C PDR3P33200 976 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C DUT1P33317 147 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C MTC2P34246 357 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YKL069WP36088 180 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C CCZ1P38273 704 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C LEU5P38702 357 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C YHR035WP38769 630 aa5.05□□□□□ -1.6
SSZ1YHR064C RRF1P38771 230 aa5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.5 ms