RNA–Protein interactions for RNA: YER148W

SPT15, Transcript of TATA-binding protein, yeastyeast

Gene SPT15, Length 723 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT15YER148W YOR387CQ08910 206 aa3.48□□□□□ -1.85
SPT15YER148W ATG34Q12292 412 aa3.48□□□□□ -1.85
SPT15YER148W MTR10Q99189 972 aa3.48□□□□□ -1.85
SPT15YER148W DEG1P31115 442 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SPT15YER148W VMA8P32610 256 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SPT15YER148W YBR137WP38276 179 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT15YER148W MTC6P38849 526 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT15YER148W VHS2P40463 436 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT15YER148W PRM5P40476 318 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT15YER148W ZIM17P42844 174 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT15YER148W TOF1P53840 1238 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT15YER148W HER2Q03557 464 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT15YER148W PPM1Q04081 328 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT15YER148W AIM32Q04689 311 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT15YER148W TSR1Q07381 788 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SPT15YER148W SRL2Q12020 392 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT15YER148W RUP1Q12242 671 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT15YER148W SMC6Q12749 1114 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT15YER148W TY1B-AO13527 1196 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SPT15YER148W SPO12P17123 173 aa3.46□□□□□ -1.86
SPT15YER148W SLY1P22213 666 aa3.46□□□□□ -1.86
SPT15YER148W NAM9P27929 486 aa3.46□□□□□ -1.86
SPT15YER148W SWH1P35845 1188 aa3.46□□□□□ -1.86
SPT15YER148W RRP4P38792 359 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SPT15YER148W NDT80P38830 627 aa3.46□□□□□ -1.86
SPT15YER148W SER3P40054 469 aa3.46□□□□□ -1.86
SPT15YER148W YPS6P40583 537 aa3.46□□□□□ -1.86
SPT15YER148W OCA2P53949 197 aa3.46□□□□□ -1.86
SPT15YER148W YNL050CP53952 270 aa3.46□□□□□ -1.86
SPT15YER148W CIK1Q01649 594 aa3.46□□□□□ -1.86
SPT15YER148W SNX3Q08826 162 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SPT15YER148W COX3P00420 269 aa3.45□□□□□ -1.86
SPT15YER148W LTV1P34078 463 aa3.45□□□□□ -1.86
SPT15YER148W YOX1P34161 385 aa3.45□□□□□ -1.86
SPT15YER148W PXA2P34230 853 aa3.45□□□□□ -1.86
SPT15YER148W ASC1P38011 319 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
SPT15YER148W WWM1P43582 211 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
SPT15YER148W YGR111WP53265 400 aa3.45□□□□□ -1.86
SPT15YER148W GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data3.45□□□□□ -1.86not detected
SPT15YER148W VPS9P54787 451 aa3.45□□□□□ -1.86
SPT15YER148W VPS54Q12071 889 aa3.45□□□□□ -1.86
SPT15YER148W AEP3Q12089 606 aa3.45□□□□□ -1.86
SPT15YER148W TMS1Q12116 473 aa3.45□□□□□ -1.86
SPT15YER148W ERP4Q12450 207 aa3.45□□□□□ -1.86
SPT15YER148W FMP27Q06179 2628 aa3.45□□□□□ -1.86
SPT15YER148W IRA1P18963 3092 aa3.45□□□□□ -1.86
SPT15YER148W RPP0P05317 312 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
SPT15YER148W POX1P13711 748 aa3.44□□□□□ -1.86
SPT15YER148W ARO3P14843 370 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
SPT15YER148W MUD1P32605 298 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
SPT15YER148W OLA1P38219 394 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
SPT15YER148W PTH1P38876 190 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
SPT15YER148W GAT2P40209 560 aa3.44□□□□□ -1.86
SPT15YER148W NCA3P46955 337 aa3.44□□□□□ -1.86
SPT15YER148W SFH5P47008 294 aa3.44□□□□□ -1.86
SPT15YER148W AZR1P50080 613 aa3.44□□□□□ -1.86
SPT15YER148W UAF30Q08747 228 aa3.44□□□□□ -1.86
SPT15YER148W HOM3P10869 527 aa3.43□□□□□ -1.86
SPT15YER148W SNA3P14359 133 aa3.43□□□□□ -1.86
SPT15YER148W RAD57P25301 460 aa3.43□□□□□ -1.86
SPT15YER148W ZTA1P38230 334 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SPT15YER148W MTM1P53320 366 aa3.43□□□□□ -1.86
SPT15YER148W BCH1Q05029 724 aa3.43□□□□□ -1.86
SPT15YER148W SNT309Q06091 175 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
SPT15YER148W TPT1Q12272 230 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SPT15YER148W SNU66Q12420 587 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
SPT15YER148W KAR9P32526 644 aa3.42□□□□□ -1.86
SPT15YER148W ALD5P40047 520 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
SPT15YER148W JLP2P40206 208 aa3.42□□□□□ -1.86
SPT15YER148W PHB2P50085 310 aa3.42□□□□□ -1.86
SPT15YER148W RHO5P53879 331 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
SPT15YER148W OAZ1Q02803 292 aa3.42□□□□□ -1.86
SPT15YER148W SMA2Q04658 369 aa3.42□□□□□ -1.86
SPT15YER148W YDR341CQ05506 607 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
SPT15YER148W YLR456WQ06199 204 aa3.42□□□□□ -1.86
SPT15YER148W RRP9Q06506 573 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
SPT15YER148W MRPL35Q06678 367 aa3.42□□□□□ -1.86
SPT15YER148W TRP1P00912 224 aa3.41□□□□□ -1.86
SPT15YER148W IMA3P0CW40 589 aa3.41□□□□□ -1.86
SPT15YER148W IMA4P0CW41 589 aa3.41□□□□□ -1.86
SPT15YER148W PET123P17558 318 aa3.41□□□□□ -1.86
SPT15YER148W ISY1P21374 235 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
SPT15YER148W DAL2P25335 343 aa3.41□□□□□ -1.86
SPT15YER148W RRP1P35178 278 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
SPT15YER148W SDS24P38314 527 aa3.41□□□□□ -1.86
SPT15YER148W LRP1P38801 184 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
SPT15YER148W STN1P38960 494 aa3.41□□□□□ -1.86
SPT15YER148W CWC25P53854 179 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
SPT15YER148W MMT1Q03218 510 aa3.41□□□□□ -1.86
SPT15YER148W HRI1Q05905 244 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
SPT15YER148W IMA2Q08295 589 aa3.41□□□□□ -1.86
SPT15YER148W RAX1Q08760 435 aa3.41□□□□□ -1.86
SPT15YER148W FDH1Q08911 376 aa3.41□□□□□ -1.86
SPT15YER148W ECM29P38737 1868 aa3.41□□□□□ -1.86
SPT15YER148W CYC3P06182 269 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT15YER148W MNS1P32906 549 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT15YER148W HEL1P36113 551 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT15YER148W MSG5P38590 489 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT15YER148W PAN6P40459 309 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT15YER148W BRO1P48582 844 aa3.4□□□□□ -1.87
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