RNA–Protein interactions for RNA: YER118C

SHO1, Transcript of Transmembrane osmosensor for filamentous growth and HOG pathways, yeastyeast

Gene SHO1, Length 1,104 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHO1YER118C DSN1P40568 576 aa6.1□□□□□ -1.43
SHO1YER118C SAD1P43589 448 aa6.1□□□□□ -1.43
SHO1YER118C TRS85P46944 698 aa6.1□□□□□ -1.43
SHO1YER118C BUL1P48524 976 aa6.1□□□□□ -1.43
SHO1YER118C BUD32P53323 261 aa6.1□□□□□ -1.43
SHO1YER118C YIF1P53845 314 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
SHO1YER118C MPS1P54199 764 aa6.1□□□□□ -1.43
SHO1YER118C YMR209CQ03648 457 aa6.1□□□□□ -1.43
SHO1YER118C HPF1Q05164 967 aa6.1□□□□□ -1.43
SHO1YER118C RTT103Q05543 409 aa6.1□□□□□ -1.43
SHO1YER118C TDA6Q06466 467 aa6.1□□□□□ -1.43
SHO1YER118C THI3Q07471 609 aa6.1□□□□□ -1.43
SHO1YER118C RAD9P14737 1309 aa6.09□□□□□ -1.43
SHO1YER118C CYC7P00045 113 aa6.09□□□□□ -1.43
SHO1YER118C MATALPHA2P0CY08 210 aa6.09□□□□□ -1.43
SHO1YER118C HMLALPHA2P0CY09 210 aa6.09□□□□□ -1.43
SHO1YER118C SNF3P10870 884 aa6.09□□□□□ -1.43
SHO1YER118C CLN3P13365 580 aa6.09□□□□□ -1.43
SHO1YER118C DAL82P21705 255 aa6.09□□□□□ -1.43
SHO1YER118C MXR2P25566 168 aa6.09□□□□□ -1.43
SHO1YER118C KAE1P36132 386 aa6.09□□□□□ -1.43
SHO1YER118C COX16P47081 118 aa6.09□□□□□ -1.43
SHO1YER118C TAF6P53040 516 aa6.09□□□□□ -1.43
SHO1YER118C BIO4P53630 237 aa6.09□□□□□ -1.43
SHO1YER118C SMM1P53720 384 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SHO1YER118C NUP116Q02630 1113 aa6.09□□□□□ -1.43
SHO1YER118C ADH6Q04894 360 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SHO1YER118C DSE3Q08729 430 aa6.09□□□□□ -1.43
SHO1YER118C TIP41Q12199 356 aa6.09□□□□□ -1.43
SHO1YER118C NCB2Q92317 146 aa6.09□□□□□ -1.43
SHO1YER118C MES1P00958 751 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
SHO1YER118C NUP1P20676 1076 aa6.08□□□□□ -1.44
SHO1YER118C GAS1P22146 559 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
SHO1YER118C PUT3P25502 979 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
SHO1YER118C ATP7P30902 174 aa6.08□□□□□ -1.44
SHO1YER118C SKN1P33336 771 aa6.08□□□□□ -1.44
SHO1YER118C PRP18P33411 251 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
SHO1YER118C RIB1P38066 345 aa6.08□□□□□ -1.44
SHO1YER118C CDC1P40986 491 aa6.08□□□□□ -1.44
SHO1YER118C YFL015CP43578 164 aa6.08□□□□□ -1.44
SHO1YER118C YJR154WP47181 346 aa6.08□□□□□ -1.44
SHO1YER118C TRM112P53738 135 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
SHO1YER118C YPL062WQ02781 134 aa6.08□□□□□ -1.44
SHO1YER118C RVB1Q03940 463 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
SHO1YER118C RRP17Q04031 235 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
SHO1YER118C YDR387CQ04162 555 aa6.08□□□□□ -1.44
SHO1YER118C SPO77Q06134 477 aa6.08□□□□□ -1.44
SHO1YER118C LDS2Q08218 356 aa6.08□□□□□ -1.44
SHO1YER118C VIK1Q12045 647 aa6.08□□□□□ -1.44
SHO1YER118C MSH5Q12175 901 aa6.08□□□□□ -1.44
SHO1YER118C YLL056CQ12177 298 aa6.08□□□□□ -1.44
SHO1YER118C ATG34Q12292 412 aa6.08□□□□□ -1.44
SHO1YER118C YER145C-AA0A023PYF4 145 aa6.07□□□□□ -1.44
SHO1YER118C RPL27AP0C2H6 136 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
SHO1YER118C RPL27BP0C2H7 136 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
SHO1YER118C ARF1P11076 181 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
SHO1YER118C VPS1P21576 704 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
SHO1YER118C ADE1P27616 306 aa6.07□□□□□ -1.44
SHO1YER118C PEX3P28795 441 aa6.07□□□□□ -1.44
SHO1YER118C VMA5P31412 392 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
SHO1YER118C APE2P32454 952 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
SHO1YER118C MYO3P36006 1272 aa6.07□□□□□ -1.44
SHO1YER118C ROT2P38138 954 aa6.07□□□□□ -1.44
SHO1YER118C STB4P50104 949 aa6.07□□□□□ -1.44
SHO1YER118C SPT20P50875 604 aa6.07□□□□□ -1.44
SHO1YER118C DIA1P54005 336 aa6.07□□□□□ -1.44
SHO1YER118C MMT1Q03218 510 aa6.07□□□□□ -1.44
SHO1YER118C KRE28Q04431 385 aa6.07□□□□□ -1.44
SHO1YER118C CDA2Q06703 312 aa6.07□□□□□ -1.44
SHO1YER118C SAM4Q08985 325 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
SHO1YER118C YRA1Q12159 226 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
SHO1YER118C SUC2P00724 532 aa6.06□□□□□ -1.44
SHO1YER118C TCP1P12612 559 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
SHO1YER118C STE18P18852 110 aa6.06□□□□□ -1.44
SHO1YER118C VMA6P32366 345 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
SHO1YER118C ZUO1P32527 433 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
SHO1YER118C MRPS5P33759 307 aa6.06□□□□□ -1.44
SHO1YER118C LST4P34239 828 aa6.06□□□□□ -1.44
SHO1YER118C MAK5P38112 773 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SHO1YER118C SUR2P38992 349 aa6.06□□□□□ -1.44
SHO1YER118C MMF1P40185 145 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
SHO1YER118C COA1P40452 197 aa6.06□□□□□ -1.44
SHO1YER118C YRB1P41920 201 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
SHO1YER118C SSN8P47821 323 aa6.06□□□□□ -1.44
SHO1YER118C NAT4Q04751 285 aa6.06□□□□□ -1.44
SHO1YER118C YDR222WQ04925 415 aa6.06□□□□□ -1.44
SHO1YER118C ARR2Q06597 130 aa6.06□□□□□ -1.44
SHO1YER118C BER1Q06688 274 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
SHO1YER118C ASA1Q06822 443 aa6.06□□□□□ -1.44
SHO1YER118C TLG2Q08144 397 aa6.06□□□□□ -1.44
SHO1YER118C RRI1Q12468 440 aa6.06□□□□□ -1.44
SHO1YER118C SEY1Q99287 776 aa6.06□□□□□ -1.44
SHO1YER118C THP2O13539 261 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SHO1YER118C ATP1P07251 545 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SHO1YER118C BAR1P12630 587 aa6.05□□□□□ -1.44
SHO1YER118C CTR86P25355 563 aa6.05□□□□□ -1.44
SHO1YER118C POP5P28005 173 aa6.05□□□□□ -1.44
SHO1YER118C TMT1P32643 299 aa6.05□□□□□ -1.44
SHO1YER118C SKT5P34226 696 aa6.05□□□□□ -1.44
SHO1YER118C CBT1P36038 271 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
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