RNA–Protein interactions for RNA: YDR369C

XRS2, Transcript of Protein required for DNA repair, yeast

Gene XRS2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
XRS2	YDR369C	FAU1	P40099	211 aa		3.47	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	YIL054W	P40524	105 aa		3.47	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	GAT1	P43574	510 aa		3.47	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	PHO86	P46956	311 aa		3.47	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	TY1A-JR2	P47099	440 aa		3.47	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	LCL3	P53153	274 aa		3.47	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	YNL095C	P53932	642 aa		3.47	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	ECM9	Q02202	377 aa		3.47	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	SMA1	Q02651	245 aa		3.47	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	TY1A-DR1	Q03856	440 aa		3.47	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	TY1A-ML1	Q04706	440 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	TVP18	Q04767	167 aa		3.47	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	LDB18	Q07887	179 aa		3.47	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	FMP25	Q08023	583 aa		3.47	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	PEX27	Q08580	376 aa		3.47	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	YLL058W	Q12198	575 aa		3.47	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	TY1A-BR	Q12217	440 aa		3.47	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	INP53	Q12271	1107 aa		3.47	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	TY1A-NL2	Q12470	440 aa		3.47	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	TY1A-GR2	Q12485	440 aa		3.47	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		3.47	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		3.47	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	MTR10	Q99189	972 aa		3.47	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	CDC7	P06243	507 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	DCC1	P25559	380 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	UBC8	P28263	218 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	RAD54	P32863	898 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	APT2	P36973	181 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SRO77	P38163	1010 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	BIT2	P38346	545 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	CYC2	P38909	366 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SLZ1	P40167	298 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	HLJ1	P48353	224 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	CTR1	P49573	406 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SOL1	P50278	321 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	KXD1	P53158	218 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	PKP2	P53170	491 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YNR061C	P53747	219 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	REG1	Q00816	1014 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	NUP116	Q02630	1113 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SKY1	Q03656	742 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	NHX1	Q04121	633 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SYT1	Q06836	1226 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YET3	Q07451	203 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	HAP2	P06774	265 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	DST1	P07273	309 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.46	□□□□□ -1.86	not detected
XRS2	YDR369C	SPO7	P18410	259 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	GRR1	P24814	1151 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	MGT1	P26188	188 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	RNP1	P32385	249 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.46	□□□□□ -1.86	not detected
XRS2	YDR369C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	TFA2	P36145	328 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	MRPL4	P36517	319 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	AFG3	P39925	761 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	VRG4	P40107	337 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	IBA57	P47158	497 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	CLA4	P48562	842 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YNL033W	P53964	284 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YNL019C	P53975	284 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.46	□□□□□ -1.86	not detected
XRS2	YDR369C	YPL014W	Q02606	381 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YDR248C	Q03786	193 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	PEX12	Q04370	399 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	HSP31	Q04432	237 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	THI7	Q05998	598 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	LCB4	Q12246	624 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	RBD2	Q12270	262 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	RTN2	Q12443	393 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		3.46	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YLR358C	O13565	187 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	PRC1	P00729	532 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	CIT1	P00890	479 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	GAL4	P04386	881 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	AAC1	P04710	309 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	PRB1	P09232	635 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	CKA1	P15790	372 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SEC59	P20048	519 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	COQ3	P27680	312 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	PEX4	P29340	183 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YKL162C	P36052	402 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	TAT1	P38085	619 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	EXO5	P38289	585 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	UBP5	P39944	805 aa		3.45	□□□□□ -1.86

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