RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C RPS8BP0CX40 200 aaKnown RBP1.59□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C RPL1AP0CX43 217 aaKnown RBP1.59□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C RPL1BP0CX44 217 aaKnown RBP1.59□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C ALG1P16661 449 aa1.59□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C HSP104P31539 908 aaKnown RBP1.59□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C MNS1P32906 549 aa1.59□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C MSG5P38590 489 aa1.59□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C STP2P38704 541 aa1.59□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C GPI16P38875 610 aa1.59□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C GDI1P39958 451 aaKnown RBP1.59□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C JLP2P40206 208 aa1.59□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C CHS6P40955 746 aa1.59□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C APJ1P53940 528 aa1.59□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C MMT1Q03218 510 aa1.59□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C YDR341CQ05506 607 aaKnown RBP1.59□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C RUP1Q12242 671 aa1.59□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C TPT1Q12272 230 aaKnown RBP1.59□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C NFT1P0CE68 1218 aa1.59□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C YCL068CP25593 260 aa1.59□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C MDL1P33310 695 aa1.59□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C YKL097CP34245 136 aa1.59□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C ATP3P38077 311 aaKnown RBP1.59□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C CHK1P38147 527 aa1.59□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C INM1P38710 295 aa1.59□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C SIM1P40472 476 aa1.59□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C BRO1P48582 844 aa1.59□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C CWC25P53854 179 aaKnown RBP1.59□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C YRM1Q12340 786 aa1.59□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C SNU66Q12420 587 aaPredicted RBP1.59□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C DAL2P25335 343 aa1.58□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C RRP7P25368 297 aaPredicted RBP1.58□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C PHO91P27514 894 aa1.58□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C KAR9P32526 644 aa1.58□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C JEM1P40358 645 aa1.58□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C ROG1P53118 685 aa1.58□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C MDG1P53885 366 aa1.58□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C CCE1Q03702 353 aa1.58□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C NSE1Q07913 336 aa1.58□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C RAX1Q08760 435 aa1.58□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C NCA2Q12374 616 aa1.58□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C EXG1P23776 448 aaKnown RBP1.58□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C POP5P28005 173 aa1.58□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C NRP1P32770 719 aaKnown RBP RIP-Chip data1.58□□□□□ -2.16not detected
HDA3YPR179C SKN1P33336 771 aa1.58□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C RRP1P35178 278 aaPredicted RBP1.58□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C MRP21P38175 177 aa1.58□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C QDR3P38227 689 aa1.58□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C PFF1P38244 976 aa1.58□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C SBE22P38814 852 aa1.58□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C MMF1P40185 145 aaKnown RBP1.58□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C SEC28P40509 296 aaKnown RBP1.58□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C TOS3P43637 560 aa1.58□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C MEH1Q02205 184 aa1.58□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C NUP116Q02630 1113 aa1.58□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C ERO1Q03103 563 aa1.58□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C NDL1Q06568 189 aa1.58□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C OPI3P05375 206 aa1.57□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C ATP1P07251 545 aaKnown RBP1.57□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C CAP2P13517 287 aa1.57□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C YSC83P32792 385 aa1.57□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C YIL029CP40538 142 aa1.57□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C PEX25Q02969 394 aa1.57□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C YDR541CQ03049 344 aa1.57□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C RNH203Q12338 110 aa1.57□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C NAM2P11325 894 aa1.56□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C SLM5P25345 492 aaKnown RBP1.56□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C PHA2P32452 334 aa1.56□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C COX13P32799 129 aa1.56□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C UTH1P36135 365 aa1.56□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C RXT2P38255 430 aa1.56□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C MLH1P38920 769 aa1.56□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C COX14P39103 70 aa1.56□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C MDE1P47095 244 aa1.56□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C STE24P47154 453 aa1.56□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C PMT5P52867 743 aa1.56□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C MRM2P53123 320 aa1.56□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C HAL1Q01766 294 aa1.56□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C RCF1Q03713 159 aa1.56□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C ECM7Q06200 448 aa1.56□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C NDE2Q07500 545 aa1.56□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C CEX1Q12453 761 aa1.56□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C HSP82P02829 709 aaKnown RBP1.56□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C HSP26P15992 214 aaKnown RBP RIP-Chip data1.56□□□□□ -2.16not detected
HDA3YPR179C PUP2P32379 260 aa1.56□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C CSE2P33308 149 aa1.56□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C MNL1P38888 796 aa1.56□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C PAC11P40960 533 aa1.56□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C YJR085CP47131 105 aaKnown RBP1.56□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C TOS2P50078 622 aa1.56□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C YIP5P53108 310 aa1.56□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C MLC1P53141 149 aa1.56□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C YGR117CP53270 476 aa1.56□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C MTQ1P53944 314 aa1.56□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C SPR6Q01684 191 aa1.56□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C URC2Q04411 772 aa1.56□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C MDM36Q06820 579 aa1.56□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C IRC25Q07951 179 aa1.56□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C AHC1Q12433 566 aa1.56□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C POM152P39685 1337 aa1.55□□□□□ -2.16
HDA3YPR179C SSC1P0CS90 654 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
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