RNA–Protein interactions for RNA: YPL253C

VIK1, Transcript of Protein that forms a kinesin-14 heterodimeric motor with Kar3p, yeast

Gene VIK1, Length 1,944 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	YPL253C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	1.02	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	1.02	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	SIL1	Q08199	421 aa		1.02	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	HSP42	Q12329	375 aa		1.02	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	CEX1	Q12453	761 aa		1.02	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	1.01	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	AGA2	P32781	87 aa		1.01	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	1.01	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	FMS1	P50264	508 aa		1.01	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	VHT1	P53241	593 aa		1.01	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	COS1	P53822	381 aa		1.01	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	1.01	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	EAF3	Q12432	401 aa		1.01	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	SCEI	P03882	235 aa		1.01	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	1.01	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	CAP2	P13517	287 aa		1.01	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	1.01	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	1.01	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	DPB3	P27344	201 aa		1.01	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	BEM1	P29366	551 aa		1.01	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	COX13	P32799	129 aa		1.01	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	VTA1	Q06263	330 aa		1.01	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	ATG34	Q12292	412 aa		1.01	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	1	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	1	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	YBR056W	P38081	501 aa		1	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	ALF1	P53904	254 aa		1	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	URH1	Q04179	340 aa		1	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	HRT1	Q08273	121 aa		1	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	VAM3	Q12241	283 aa		1	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	SKN1	P33336	771 aa		0.99	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	GRX6	Q12438	231 aa		0.99	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	SMF1	P38925	575 aa		0.99	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	FHL1	P39521	936 aa		0.99	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	GAT2	P40209	560 aa		0.99	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	HST4	P53688	370 aa		0.99	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	0.99	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	PRM6	Q04705	352 aa		0.99	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	0.99	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	YDL114W	Q07530	308 aa		0.99	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	ARG3	P05150	338 aa		0.98	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	STE7	P06784	515 aa		0.98	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	PEX22	P39718	180 aa		0.98	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	VID27	P40157	782 aa		0.98	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	YIR035C	P40579	254 aa		0.98	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	TOS3	P43637	560 aa		0.98	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	COS5	P47187	383 aa		0.98	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	COQ5	P49017	307 aa		0.98	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	0.98	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	YLR345W	Q06137	509 aa		0.98	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	COS7	Q07788	383 aa		0.98	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	BUG1	Q12191	341 aa		0.98	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	NCA2	Q12374	616 aa		0.98	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	IMA3	P0CW40	589 aa		0.97	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	IMA4	P0CW41	589 aa		0.97	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	CMK2	P22517	447 aa		0.97	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	RRN10	P38204	145 aa		0.97	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	IMA2	Q08295	589 aa		0.97	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	FCY22	Q12119	530 aa		0.97	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	YOL085C	Q99345	113 aa		0.97	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	PDC2	P32896	925 aa		0.97	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	TIM10	P87108	93 aa		0.97	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		0.97	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	HOM3	P10869	527 aa		0.96	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	FUN26	P31381	517 aa		0.96	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.96	□□□□□ -2.26	not detected
VIK1	YPL253C	YPS6	P40583	537 aa		0.96	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	YJL144W	P47009	104 aa		0.96	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	STD1	Q02794	444 aa		0.96	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	YDL199C	Q12407	687 aa		0.96	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	CLC1	P17891	233 aa		0.95	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	GIT1	P25346	518 aa		0.95	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	AST1	P35183	429 aa		0.95	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	SOL2	P37262	315 aa		0.95	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	SMP1	P38128	452 aa		0.95	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	MMS4	P38257	691 aa		0.95	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	0.95	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	0.95	□□□□□ -2.26	not detected
VIK1	YPL253C	STB1	P42845	420 aa		0.95	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	ZRG17	P53735	605 aa		0.95	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	MMT1	Q03218	510 aa		0.95	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	COG4	Q06096	861 aa		0.95	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	MCT1	Q12283	360 aa		0.95	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	ASP3-2	P0CX77	362 aa		0.95	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	ASP3-3	P0CX78	362 aa		0.95	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	ASP3-4	P0CX79	362 aa		0.95	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		0.95	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	MSP1	P28737	362 aa		0.95	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	IMP2'	P32351	346 aa		0.95	□□□□□ -2.26
VIK1	YPL253C	ECM34	P38728	170 aa		0.95	□□□□□ -2.26

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