RNA–Protein interactions for RNA: YOR163W

DDP1, Transcript of Polyphosphate phosphatase, yeast

Gene DDP1, Length 567 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDP1	YOR163W	SPE2	P21182	396 aa		3.58	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	DAL2	P25335	343 aa		3.58	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	CWP1	P28319	239 aa		3.58	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	ITR1	P30605	584 aa		3.58	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	GDA1	P32621	518 aa		3.58	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	CYM1	P32898	989 aa		3.58	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	DUG2	P38149	878 aa		3.58	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	MAL32	P38158	584 aa		3.58	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	TSC10	P38342	320 aa		3.58	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	ANS1	P38832	159 aa		3.58	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	SPC97	P38863	823 aa		3.58	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	PET100	P38958	111 aa		3.58	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	STN1	P38960	494 aa		3.58	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	SCS3	P53012	380 aa		3.58	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	YIP4	P53093	235 aa		3.58	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	MAL12	P53341	584 aa		3.58	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	YNL260C	P53846	198 aa		3.58	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	ESBP6	P53918	673 aa		3.58	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	RSM23	Q01163	450 aa		3.58	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	PDR8	Q06149	701 aa		3.58	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	YDL057W	Q07379	328 aa		3.58	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	MLH3	Q12083	715 aa		3.58	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		3.58	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	RHO2	P06781	192 aa		3.57	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		3.57	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		3.57	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	RAP1	P11938	827 aa		3.57	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	YPK2	P18961	677 aa		3.57	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	SIN4	P32259	974 aa		3.57	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	MSS51	P32335	436 aa		3.57	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	RPC25	P35718	212 aa		3.57	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	KDX1	P36005	433 aa		3.57	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	RTC2	P38279	296 aa		3.57	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	STP2	P38704	541 aa		3.57	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	DBP8	P38719	431 aa		3.57	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	FET3	P38993	636 aa		3.57	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	SNL1	P40548	159 aa		3.57	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	NMA2	P53204	395 aa		3.57	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	DIP5	P53388	608 aa		3.57	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	RET3	P53600	189 aa		3.57	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	SLG1	P54867	378 aa		3.57	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	SLT2	Q00772	484 aa		3.57	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	TRS23	Q03784	219 aa		3.57	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	BNA7	Q04066	261 aa		3.57	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	YDL086W	Q07505	273 aa		3.57	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	SOR2	Q07786	357 aa		3.57	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	TGS1	Q12052	315 aa		3.57	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	YOR029W	Q12243	111 aa		3.57	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	LCB4	Q12246	624 aa		3.57	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	GLE1	Q12315	538 aa		3.57	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	RMD5	Q12508	421 aa		3.57	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	DNF3	Q12674	1656 aa		3.57	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	HAP1	P0CE41	1502 aa		3.56	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	SRB8	P25648	1427 aa		3.56	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	MSF1	P08425	469 aa		3.56	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	ABF1	P14164	731 aa		3.56	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	ATP10	P18496	279 aa		3.56	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	GPI12	P23797	304 aa		3.56	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	CSM1	P25651	190 aa		3.56	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	CIN8	P27895	1000 aa		3.56	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	YPT10	P38146	199 aa		3.56	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	RRN10	P38204	145 aa		3.56	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	EFM2	P38347	419 aa		3.56	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	YMR262W	P38430	313 aa		3.56	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	SPG5	P42933	373 aa		3.56	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	FMP33	P46998	180 aa		3.56	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	RMR1	P53060	241 aa		3.56	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	DSL1	P53847	754 aa		3.56	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	SMC5	Q08204	1093 aa		3.56	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	RDR1	Q08904	546 aa		3.56	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	GET4	Q12125	312 aa		3.56	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	USV1	Q12132	391 aa		3.56	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	YDR262W	Q12331	272 aa		3.56	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	ATG31	Q12421	196 aa		3.56	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.55	□□□□□ -1.84	not detected
DDP1	YOR163W	SCEI	P03882	235 aa		3.55	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
DDP1	YOR163W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84

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