RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	LDB18	Q07887	179 aa		5.44	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	PGC1	Q08959	321 aa		5.44	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	HUA2	Q12134	243 aa		5.44	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	SCM3	Q12334	223 aa		5.44	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	TRM13	Q12383	476 aa		5.44	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	INH1	P01097	85 aa		5.43	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	MET17	P06106	444 aa		5.43	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	ALG7	P07286	448 aa		5.43	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	CBS2	P14905	389 aa		5.43	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	CLN1	P20437	546 aa		5.43	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	FUB1	P25659	250 aa		5.43	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	UBC8	P28263	218 aa		5.43	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	PEX3	P28795	441 aa		5.43	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	MRPL6	P32904	214 aa		5.43	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	YHL026C	P38740	315 aa		5.43	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	YHR045W	P38775	560 aa		5.43	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	MTG2	P38860	518 aa		5.43	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	AXL2	P38928	823 aa		5.43	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	ESL1	P40456	1118 aa		5.43	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	GCD10	P41814	478 aa		5.43	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	BNA1	P47096	177 aa		5.43	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	SPC98	P53540	846 aa		5.43	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	RSC9	Q03124	581 aa		5.43	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	5.43	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	ARP10	Q04549	284 aa		5.43	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	IZH3	Q07959	543 aa		5.43	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	UIP4	Q08926	304 aa		5.43	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	5.43	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	MED2	Q12124	431 aa		5.43	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	JLP1	Q12358	412 aa		5.43	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	TRM10	Q12400	293 aa		5.43	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		5.43	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	RIB3	Q99258	208 aa		5.43	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	RPN13	O13563	156 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	RAD7	P06779	565 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	MRP13	P12686	339 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	SYN8	P31377	255 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	THI80	P35202	319 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	IPT1	P38954	527 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	YER010C	P40011	234 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	JLP2	P40206	208 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	AYR1	P40471	297 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	OPT1	P40897	799 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	SKP2	P42843	763 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	BST1	P43571	1029 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	GLG2	P47011	380 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	PHO23	P50947	330 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	FHN1	P53279	174 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	YPL107W	Q02873	248 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	GOT1	Q03554	138 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	TAF12	Q03761	539 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	ECM11	Q04110	302 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	YDR124W	Q04608	324 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	RCO1	Q04779	684 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	RIF2	Q06208	395 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	ARR3	Q06598	404 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	YDL086W	Q07505	273 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	MLH3	Q12083	715 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	USV1	Q12132	391 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	LCB4	Q12246	624 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	ICT1	Q12385	394 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	MHF2	Q3E829	80 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	SPT3	P06844	337 aa		5.41	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	NFT1	P0CE68	1218 aa		5.41	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	YCR099C	P25657	155 aa		5.41	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	PPZ1	P26570	692 aa		5.41	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	ELF1	P36053	145 aa		5.41	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	RIB1	P38066	345 aa		5.41	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	FMP23	P38231	175 aa		5.41	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	MTW1	P39731	289 aa		5.41	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	FCY21	P40039	528 aa		5.41	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	FAR7	P43592	221 aa		5.41	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	GTO1	P48239	356 aa		5.41	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	GPI8	P49018	411 aa		5.41	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	TWF1	P53250	332 aa		5.41	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	SHY1	P53266	389 aa		5.41	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	TIM13	P53299	105 aa		5.41	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	COG5	P53951	403 aa		5.41	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	BCH1	Q05029	724 aa		5.41	□□□□□ -1.54

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