RNA–Protein interactions for RNA: YMR198W

CIK1, Transcript of Kinesin-associated protein, yeast

Gene CIK1, Length 1,785 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIK1	YMR198W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	SSO2	P39926	295 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	YGR210C	P42942	411 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	EFM3	P47163	339 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	AVT4	P50944	713 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	SDT1	P53078	280 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	YNL050C	P53952	270 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	STE2	D6VTK4	431 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	CDC42	P19073	191 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	RML2	P32611	393 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	TCD1	P38756	429 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	PRM1	P53835	661 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	ATC1	Q04005	294 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	YLR297W	Q05899	129 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	BOP2	Q06150	570 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	YFH1	Q07540	174 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	BUG1	Q12191	341 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	RLM1	Q12224	676 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	LDB17	Q12342	491 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	HRT3	Q12347	344 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	BUB3	P26449	341 aa		3	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	NDI1	P32340	513 aa		3	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	ATP11	P32453	318 aa		3	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	MSN4	P33749	630 aa		3	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	PFF1	P38244	976 aa		3	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	MLH1	P38920	769 aa		3	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	ALG5	P40350	334 aa		3	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	YGR149W	P48236	432 aa		3	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	CAF40	P53829	373 aa		3	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	PNG1	Q02890	363 aa		3	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	BCP1	Q06338	283 aa		3	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	AEP3	Q12089	606 aa		3	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	VPS63	O13549	108 aa		3	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	STE3	P06783	470 aa		3	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	COR1	P07256	457 aa		3	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	KSS1	P14681	368 aa		3	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	PET18	P25362	215 aa		3	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	3	□□□□□ -1.93	not detected
CIK1	YMR198W	FRE2	P36033	711 aa		3	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	SLX1	P38324	304 aa		3	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	MSG5	P38590	489 aa		3	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	MSR1	P38714	643 aa		3	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	SER3	P40054	469 aa		3	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	REE1	P40893	198 aa		3	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	FMS1	P50264	508 aa		3	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	YLR152C	P54072	576 aa		3	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	SKO1	Q02100	647 aa		3	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	ACL4	Q03771	387 aa		3	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	CSI1	Q04368	295 aa		3	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	CUR1	Q06469	252 aa		3	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	SPO7	P18410	259 aa		2.99	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.99	□□□□□ -1.93	not detected
CIK1	YMR198W	KKQ8	P36004	724 aa		2.99	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	ECM27	P47144	725 aa		2.99	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	YGL138C	P53122	345 aa		2.99	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	FIN1	Q03898	291 aa		2.99	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	YLR173W	Q06247	608 aa		2.99	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	ESA1	Q08649	445 aa		2.99	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	MED4	Q12343	284 aa		2.99	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	AHC1	Q12433	566 aa		2.99	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	PRB1	P09232	635 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	CPR4	P25334	318 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	RDS1	P25611	832 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	MEI5	P32489	222 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	SUA5	P32579	426 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	SIP3	P38717	1229 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CIK1	YMR198W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93

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