RNA–Protein interactions for RNA: YLR119W

SRN2, Transcript of Component of the ESCRT-I complex, yeast

Gene SRN2, Length 642 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SRN2	YLR119W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	CDC21	P06785	304 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	FAD1	P38913	306 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	PIB2	P53191	635 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	MDM36	Q06820	579 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	BSC6	Q08280	497 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	UAF30	Q08747	228 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	NCA2	Q12374	616 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	PDE2	P06776	526 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	GPM3	Q12326	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	JID1	Q12350	301 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	INM1	P38710	295 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	TOS3	P43637	560 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	NSE1	Q07913	336 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	LOT6	Q07923	191 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	PHA2	P32452	334 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	COX13	P32799	129 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	SBE22	P38814	852 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	YLR152C	P54072	576 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	PEX5	P35056	612 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	SIM1	P40472	476 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	MAM33	P40513	266 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	YJL055W	P47044	245 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	ADA2	Q02336	434 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	GYL1	Q04322	720 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	ERP4	Q12450	207 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SRN2	YLR119W	ALG1	P16661	449 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	RPB5	P20434	215 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	SKN1	P33336	771 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	MRPL10	P36520	322 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	MRM2	P53123	320 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	IZH2	Q12442	317 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	CAP2	P13517	287 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	PRR1	P28708	518 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	CSE2	P33308	149 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	SKT5	P34226	696 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	YDR541C	Q03049	344 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	PRM6	Q04705	352 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	RIF2	Q06208	395 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	SMC5	Q08204	1093 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	PLP2	Q12017	286 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	POM152	P39685	1337 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	PHO91	P27514	894 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	HXT1	P32465	570 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	YEF1	P32622	495 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	PAC11	P40960	533 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	GAB1	P41733	394 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	YFR057W	P43625	151 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	TIS11	P47977	285 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	YMR102C	Q03177	834 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	NDL1	Q06568	189 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	EAF3	Q12432	401 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	RIP-Chip
SRN2	YLR119W	MSI1	P13712	422 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
SRN2	YLR119W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	CHS6	P40955	746 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	HAC1	P41546	238 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	YGR117C	P53270	476 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	NUP2	P32499	720 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	GPI16	P38875	610 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	AIM24	P47127	394 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	RSC1	P53236	928 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	STP2	P38704	541 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	LCB2	P40970	561 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	LCB3	P47013	409 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	ROG1	P53118	685 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	MST27	P53176	234 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	SPR6	Q01684	191 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SRN2	YLR119W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	QDR3	P38227	689 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	RTC2	P38279	296 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	ATM1	P40416	690 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	DFG10	P40526	253 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	BIR1	P47134	954 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	STE24	P47154	453 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SRN2	YLR119W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65

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