RNA–Protein interactions for RNA: YJL057C

IKS1, Transcript of Protein kinase of unknown cellular role, yeast

Gene IKS1, Length 2,004 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IKS1	YJL057C	MRX5	P47007	382 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	LYS5	P50113	272 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	MRS2	Q01926	470 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	UBP16	Q02863	499 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	YMR209C	Q03648	457 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	FAR8	Q05040	523 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	TRM11	Q12463	433 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	SEY1	Q99287	776 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	SCEI	P03882	235 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	COR1	P07256	457 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	DSF1	P0CX08	502 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.21	□□□□□ -1.74	not detected
IKS1	YJL057C	CNE1	P27825	502 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	RGT1	P32862	1170 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	HES1	P35843	434 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	DTR1	P38125	572 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	FES1	P38260	290 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	AME1	P38313	324 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	VHC1	P38329	1120 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	OSH7	P38755	437 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	FMO1	P38866	432 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	MBB1	P39534	108 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	YNL194C	P40169	301 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	YKE4	P40544	346 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	YIR016W	P40572	265 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	YPT11	P48559	417 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	YIP3	P53633	176 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	BUR2	Q05949	395 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	SHS1	Q07657	551 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	TEN1	Q07921	160 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	ESA1	Q08649	445 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	QCR7	P00128	127 aa		4.2	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.2	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	AMD2	P22580	549 aa		4.2	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	ACH1	P32316	526 aa		4.2	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	CDC5	P32562	705 aa		4.2	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	LIP5	P32875	414 aa		4.2	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	GAT2	P40209	560 aa		4.2	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	PAC11	P40960	533 aa		4.2	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	CUZ1	P53899	274 aa		4.2	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	YDC1	Q02896	317 aa		4.2	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	COQ11	Q05892	277 aa		4.2	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	SOR2	Q07786	357 aa		4.2	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	AAD15	Q08361	143 aa		4.2	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	YPR1	Q12458	312 aa		4.2	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	CKI1	P20485	582 aa		4.19	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	CNA1	P23287	553 aa		4.19	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	ERG9	P29704	444 aa		4.19	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	RRN10	P38204	145 aa		4.19	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	ICS2	P38284	255 aa		4.19	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	COA1	P40452	197 aa		4.19	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	SNL1	P40548	159 aa		4.19	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	PTR3	P43606	678 aa		4.19	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	PMT5	P52867	743 aa		4.19	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	YDR109C	Q04585	715 aa		4.19	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	YEH2	Q07950	538 aa		4.19	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	GAS5	Q08193	484 aa		4.19	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	GPM2	Q12008	311 aa		4.19	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	RNH203	Q12338	110 aa		4.19	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	TRM13	Q12383	476 aa		4.19	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.19	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.19	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	RHO2	P06781	192 aa		4.19	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	INM1	P38710	295 aa		4.19	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	SLM1	P40485	686 aa		4.19	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	MRPL50	P53724	139 aa		4.19	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	YNL092W	P53934	400 aa		4.19	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	IZH3	Q07959	543 aa		4.19	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.19	□□□□□ -1.74	not detected
IKS1	YJL057C	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	DAP1	Q12091	152 aa		4.19	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	SWM1	Q12379	170 aa		4.19	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.18	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	HTB2	P02294	131 aa		4.18	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	ATP10	P18496	279 aa		4.18	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	RBK1	P25332	333 aa		4.18	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	MSK1	P32048	576 aa		4.18	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	AIM26	P32858	118 aa		4.18	□□□□□ -1.74

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