RNA–Protein interactions for RNA: YJL013C

MAD3, Transcript of Subunit of spindle-assembly checkpoint complex, yeast

Gene MAD3, Length 1,548 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MAD3	YJL013C	GLN3	P18494	730 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	SWC5	P38326	303 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	YHR122W	P38829	231 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	ALF1	P53904	254 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	CAB5	Q03941	241 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	AIM33	Q04516	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	SPO24	Q3E752	67 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	HEM2	P05373	342 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	TRS65	P32893	560 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	YKL097C	P34245	136 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	SSN8	P47821	323 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	POP6	P53218	158 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	THI7	Q05998	598 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	GEP3	Q08622	556 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	TPK3	P05986	398 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	CLN3	P13365	580 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	SHO1	P40073	367 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	GCD10	P41814	478 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	LAM5	P43560	674 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	AVT4	P50944	713 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	ARK1	P53974	638 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	YPL068C	Q02749	293 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	MRP51	Q02950	344 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	MRPL35	Q06678	367 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	NCA2	Q12374	616 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	APC2	Q12440	853 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	STE2	D6VTK4	431 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	ITR1	P30605	584 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	RTC2	P38279	296 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	HAT2	P39984	401 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	TOS3	P43637	560 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	IKS1	P47042	667 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	RRN5	Q02983	363 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	ECM18	Q04623	453 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	COQ11	Q05892	277 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	YAP7	Q08182	245 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	YDR262W	Q12331	272 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	MAS2	P11914	482 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	UGA1	P17649	471 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	PTR2	P32901	601 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	SKT5	P34226	696 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	YUH1	P35127	236 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	MST28	P39552	234 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	TOS2	P50078	622 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	VOA1	P53262	265 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	SPR6	Q01684	191 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	YLH47	Q06493	454 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	YPL199C	Q08954	240 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	CEX1	Q12453	761 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	CKI1	P20485	582 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	YCR022C	P25620	114 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	YPS1	P32329	569 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	YJL070C	P40361	888 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	YGR117C	P53270	476 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	STP1	Q00947	519 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	SPO19	Q03029	223 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	PIR3	Q03180	325 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	SMP3	Q04174	516 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	DSE3	Q08729	430 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	YOP1	Q12402	180 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	RGS2	Q99188	309 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MAD3	YJL013C	MNS1	P32906	549 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
MAD3	YJL013C	KKQ8	P36004	724 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	PEX18	P38855	283 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	ALG8	P40351	577 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	RRG8	Q06109	277 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MAD3	YJL013C	VAC14	Q06708	880 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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