RNA–Protein interactions for RNA: YGL238W

CSE1, Transcript of Nuclear envelope protein that mediates the nuclear export of Srp1p, yeast

Gene CSE1, Length 2,883 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSE1	YGL238W	PFF1	P38244	976 aa		0.34	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	STP2	P38704	541 aa		0.34	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	YEL057C	P39983	233 aa		0.34	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	COS4	P43542	379 aa		0.34	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	HST4	P53688	370 aa		0.34	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	YMR102C	Q03177	834 aa		0.34	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	TCO89	Q08921	799 aa		0.34	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	CTI6	Q08923	506 aa		0.34	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	UBR2	Q07963	1872 aa		0.33	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	YLR278C	Q05854	1341 aa		0.33	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	REC114	P32841	428 aa		0.33	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	CNS1	P33313	385 aa		0.33	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	0.33	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	YAL037W	P39728	267 aa		0.33	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	MST27	P53176	234 aa		0.33	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	ZRG17	P53735	605 aa		0.33	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	IPI3	P53877	555 aa		0.33	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	MDG1	P53885	366 aa		0.33	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	HSP31	Q04432	237 aa		0.33	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	NDE2	Q07500	545 aa		0.33	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	YOR376W	Q08900	122 aa		0.33	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	PSK1	P31374	1356 aa		0.33	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	RAV1	P47104	1357 aa		0.33	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	UBP11	P36026	717 aa		0.33	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	OXA1	P39952	402 aa		0.33	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	DFG10	P40526	253 aa		0.33	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	VTC2	P43585	828 aa		0.33	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	CRH1	P53301	507 aa		0.33	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	GPI15	P53961	229 aa		0.33	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	SGT1	Q08446	395 aa		0.33	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	0.33	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	YAR066W	P0CX18	203 aa		0.32	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	YHR214W	P0CX19	203 aa		0.32	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	0.32	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	WSS1	P38838	269 aa		0.32	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	PCL7	P40186	285 aa		0.32	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	MRX6	P48564	524 aa		0.32	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	AZR1	P50080	613 aa		0.32	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	TDA1	Q03533	586 aa		0.32	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	0.32	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	CEX1	Q12453	761 aa		0.32	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	CDC16	P09798	840 aa		0.32	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	HEM14	P40012	539 aa		0.32	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	GAT2	P40209	560 aa		0.32	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	0.32	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	0.32	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	MEP3	P53390	489 aa		0.32	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	YDR387C	Q04162	555 aa		0.32	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	NBP2	Q12163	236 aa		0.32	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	SEC39	Q12745	709 aa		0.32	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		0.32	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	LYS2	P07702	1392 aa		0.32	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	PUT4	P15380	627 aa		0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	MKK1	P32490	508 aa		0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	CST26	P38226	397 aa		0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	FRT2	P39734	528 aa		0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	PET130	P47065	347 aa		0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	YJR008W	P47085	338 aa		0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	YGL262W	P53054	175 aa		0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	YGR266W	P53326	701 aa		0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	MDM36	Q06820	579 aa		0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	PEP3	P27801	918 aa		0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	PRR1	P28708	518 aa		0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	FUN26	P31381	517 aa		0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	SMP1	P38128	452 aa		0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	YIL089W	P40500	205 aa		0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	SFH5	P47008	294 aa		0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	MKC7	P53379	596 aa		0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	JJJ1	P53863	590 aa		0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	YML131W	Q03102	365 aa		0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	URH1	Q04179	340 aa		0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	ISN1	Q99312	450 aa		0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	TUS1	Q06412	1307 aa		0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.31	□□□□□ -2.36	not detected
CSE1	YGL238W	ZRC1	P20107	442 aa		0.31	□□□□□ -2.36

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