RNA–Protein interactions for RNA: YER148W

SPT15, Transcript of TATA-binding protein, yeastyeast

Gene SPT15, Length 723 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT15YER148W IRC4Q03036 179 aa3.54□□□□□ -1.84
SPT15YER148W YMR181CQ03231 154 aa3.54□□□□□ -1.84
SPT15YER148W TAF12Q03761 539 aa3.54□□□□□ -1.84
SPT15YER148W TIM18Q08749 192 aa3.54□□□□□ -1.84
SPT15YER148W ARG4P04076 463 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
SPT15YER148W SAM1P10659 382 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
SPT15YER148W SPT15P13393 240 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
SPT15YER148W SRV2P17555 526 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
SPT15YER148W SAM2P19358 384 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
SPT15YER148W CLB1P24868 471 aa3.53□□□□□ -1.84
SPT15YER148W CTR86P25355 563 aa3.53□□□□□ -1.84
SPT15YER148W LSB5P25369 354 aa3.53□□□□□ -1.84
SPT15YER148W DBF4P32325 704 aa3.53□□□□□ -1.84
SPT15YER148W NIP1P32497 812 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
SPT15YER148W HOT1Q03213 719 aa3.53□□□□□ -1.84
SPT15YER148W ACL4Q03771 387 aa3.53□□□□□ -1.84
SPT15YER148W YLR345WQ06137 509 aa3.53□□□□□ -1.84
SPT15YER148W REX4Q08237 289 aa3.53□□□□□ -1.84
SPT15YER148W SKI7Q08491 747 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
SPT15YER148W ESA1Q08649 445 aa3.53□□□□□ -1.84
SPT15YER148W YPR022CQ12139 1133 aa3.53□□□□□ -1.84
SPT15YER148W ERV2Q12284 196 aa3.53□□□□□ -1.84
SPT15YER148W GCN1P33892 2672 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
SPT15YER148W VMA2P16140 517 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
SPT15YER148W URA4P20051 364 aa3.52□□□□□ -1.85
SPT15YER148W CPR2P23285 205 aa3.52□□□□□ -1.85
SPT15YER148W TFB1P32776 642 aa3.52□□□□□ -1.85
SPT15YER148W SOR1P35497 357 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
SPT15YER148W MMS4P38257 691 aa3.52□□□□□ -1.85
SPT15YER148W YAL037WP39728 267 aa3.52□□□□□ -1.85
SPT15YER148W YFL067WP43537 175 aa3.52□□□□□ -1.85
SPT15YER148W LAM5P43560 674 aa3.52□□□□□ -1.85
SPT15YER148W YMR130WQ04223 302 aa3.52□□□□□ -1.85
SPT15YER148W SOR2Q07786 357 aa3.52□□□□□ -1.85
SPT15YER148W YLR108CQ12259 485 aa3.52□□□□□ -1.85
SPT15YER148W ORT1Q12375 292 aa3.52□□□□□ -1.85
SPT15YER148W RMD5Q12508 421 aa3.52□□□□□ -1.85
SPT15YER148W SEN1Q00416 2231 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
SPT15YER148W SWI1P09547 1314 aa3.51□□□□□ -1.85
SPT15YER148W SAC3P46674 1301 aa3.51□□□□□ -1.85
SPT15YER148W IRA2P19158 3079 aa3.51□□□□□ -1.85
SPT15YER148W SUP35P05453 685 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
SPT15YER148W CLN1P20437 546 aa3.51□□□□□ -1.85
SPT15YER148W BRF1P29056 596 aa3.51□□□□□ -1.85
SPT15YER148W ITR1P30605 584 aa3.51□□□□□ -1.85
SPT15YER148W SDH3P33421 198 aa3.51□□□□□ -1.85
SPT15YER148W SLM4P38247 162 aa3.51□□□□□ -1.85
SPT15YER148W RRT2P38332 387 aa3.51□□□□□ -1.85
SPT15YER148W FAA2P39518 744 aa3.51□□□□□ -1.85
SPT15YER148W HMS2P47175 358 aa3.51□□□□□ -1.85
SPT15YER148W TCB2P48231 1178 aa3.51□□□□□ -1.85
SPT15YER148W FRE4P53746 719 aa3.51□□□□□ -1.85
SPT15YER148W RSN1Q03516 953 aa3.51□□□□□ -1.85
SPT15YER148W DCS1Q06151 350 aa3.51□□□□□ -1.85
SPT15YER148W MMR1Q06324 491 aa3.51□□□□□ -1.85
SPT15YER148W UBR2Q07963 1872 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT15YER148W HHF1P02309 103 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SPT15YER148W TEF1P02994 458 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SPT15YER148W ILV5P06168 395 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SPT15YER148W POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data3.5□□□□□ -1.85not detected
SPT15YER148W ERV1P27882 189 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT15YER148W ARO2P28777 376 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SPT15YER148W PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data3.5□□□□□ -1.85not detected
SPT15YER148W YBL059WP34224 193 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT15YER148W YBR139WP38109 508 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT15YER148W RIB5P38145 238 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT15YER148W RRN10P38204 145 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT15YER148W PCF11P39081 626 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SPT15YER148W YIL067CP40514 678 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT15YER148W OST1P41543 476 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SPT15YER148W SPG5P42933 373 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT15YER148W PHO86P46956 311 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT15YER148W YML6P51998 286 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT15YER148W GPI15P53961 229 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT15YER148W HEL2Q05580 639 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SPT15YER148W DIS3Q08162 1001 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SPT15YER148W RSA1Q08932 381 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT15YER148W ISA2Q12425 185 aa3.5□□□□□ -1.85
SPT15YER148W CPR4P25334 318 aa3.49□□□□□ -1.85
SPT15YER148W KKQ8P36004 724 aa3.49□□□□□ -1.85
SPT15YER148W REE1P40893 198 aa3.49□□□□□ -1.85
SPT15YER148W YFH7P43591 353 aa3.49□□□□□ -1.85
SPT15YER148W MPP10P47083 593 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SPT15YER148W BTN2P53286 410 aa3.49□□□□□ -1.85
SPT15YER148W GOR1P53839 350 aa3.49□□□□□ -1.85
SPT15YER148W ELP3Q02908 557 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SPT15YER148W GIP3Q03016 1276 aa3.49□□□□□ -1.85
SPT15YER148W PBA1Q05778 276 aa3.49□□□□□ -1.85
SPT15YER148W MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SPT15YER148W ADE4P04046 510 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
SPT15YER148W MDH1P17505 334 aaKnown RBP RIP-Chip data3.48□□□□□ -1.85not detected
SPT15YER148W SPO7P18410 259 aa3.48□□□□□ -1.85
SPT15YER148W YBL028CP38202 106 aa3.48□□□□□ -1.85
SPT15YER148W RFS1P38234 210 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
SPT15YER148W SRP72P38688 640 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
SPT15YER148W YGR210CP42942 411 aa3.48□□□□□ -1.85
SPT15YER148W HXT11P54862 567 aa3.48□□□□□ -1.85
SPT15YER148W BET5Q03630 159 aa3.48□□□□□ -1.85
SPT15YER148W RPN9Q04062 393 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
SPT15YER148W URH1Q04179 340 aa3.48□□□□□ -1.85
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