RNA–Protein interactions for RNA: YER116C

SLX8, Transcript of Subunit of Slx5-Slx8 SUMO-targeted ubiquitin ligase (STUbL) complex, yeast

Gene SLX8, Length 825 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX8	YER116C	PRM15	Q03262	622 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	AIM33	Q04516	312 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	YDR222W	Q04925	415 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	NNT1	Q05874	261 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	COQ11	Q05892	277 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	YDL057W	Q07379	328 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	SOR2	Q07786	357 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	YOL075C	Q08234	1294 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	TRM11	Q12463	433 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
SLX8	YER116C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	SCEI	P03882	235 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	STE18	P18852	110 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	ADE1	P27616	306 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	PEX3	P28795	441 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	MSK1	P32048	576 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	YPK3	P38070	525 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	MIC12	P38341	106 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	STP2	P38704	541 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	DBP8	P38719	431 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	ANS1	P38832	159 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	GAT2	P40209	560 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	YIL001W	P40560	513 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	YDL186W	P48568	277 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	YGR168C	P53293	376 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	ECM11	Q04110	302 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	YMR087W	Q04299	284 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	THI7	Q05998	598 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	GMC2	Q06201	188 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	AFT2	Q08957	416 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	YDL109C	Q12103	647 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	FRE7	Q12333	620 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	TRM13	Q12383	476 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	RRI1	Q12468	440 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	SEY1	Q99287	776 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	TUS1	Q06412	1307 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	OPI3	P05375	206 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	RRT12	P25381	491 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	ERG9	P29704	444 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	AST1	P35183	429 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	SPT10	P35208	640 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	SNZ3	P43545	298 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	YGL159W	P53110	370 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	SNZ2	P53824	298 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	YNL092W	P53934	400 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	RSM23	Q01163	450 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	YMR209C	Q03648	457 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.82	□□□□□ -1.8	not detected
SLX8	YER116C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	RGS2	Q99188	309 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	FSH3	Q99369	266 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	HIS5	P07172	385 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	SNF6	P18888	332 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	DAL82	P21705	255 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	FUB1	P25659	250 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	ACH1	P32316	526 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	SHP1	P34223	423 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	THI80	P35202	319 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	YKL162C	P36052	402 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	CTP1	P38152	299 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	POP7	P38291	140 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	HIS2	P38635	335 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	BAP3	P41815	604 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	PHO86	P46956	311 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	YIP4	P53093	235 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	DIP5	P53388	608 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	BUD17	P53727	317 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	MTQ1	P53944	314 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	NUP116	Q02630	1113 aa		3.81	□□□□□ -1.8

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