RNA–Protein interactions for RNA: YER113C

TMN3, Transcript of Protein with a role in cellular adhesion and filamentous growth, yeastyeast

Gene TMN3, Length 2,121 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMN3YER113C TAX4P47030 604 aa2.32□□□□□ -2.04
TMN3YER113C YJR149WP47177 404 aa2.32□□□□□ -2.04
TMN3YER113C COS12P53053 380 aa2.32□□□□□ -2.04
TMN3YER113C MDM34P53083 459 aa2.32□□□□□ -2.04
TMN3YER113C GTR2P53290 341 aa2.32□□□□□ -2.04
TMN3YER113C MRS2Q01926 470 aa2.32□□□□□ -2.04
TMN3YER113C GAS3Q03655 524 aa2.32□□□□□ -2.04
TMN3YER113C VHS1Q03785 461 aa2.32□□□□□ -2.04
TMN3YER113C YMR034CQ05131 434 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
TMN3YER113C ENT2Q05785 613 aa2.32□□□□□ -2.04
TMN3YER113C RIF2Q06208 395 aa2.32□□□□□ -2.04
TMN3YER113C ATG29Q12092 213 aa2.32□□□□□ -2.04
TMN3YER113C SUL2Q12325 893 aa2.32□□□□□ -2.04
TMN3YER113C BRR1Q99177 341 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
TMN3YER113C AAC1P04710 309 aa2.31□□□□□ -2.04
TMN3YER113C GUK1P15454 187 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
TMN3YER113C PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
TMN3YER113C EXO70P19658 623 aa2.31□□□□□ -2.04
TMN3YER113C PPH21P23594 369 aa2.31□□□□□ -2.04
TMN3YER113C BUB2P26448 306 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
TMN3YER113C RPC19P28000 142 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
TMN3YER113C CDC5P32562 705 aa2.31□□□□□ -2.04
TMN3YER113C MGM101P32787 269 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
TMN3YER113C CBF5P33322 483 aaKnown RBP RIP-Chip data2.31□□□□□ -2.04not detected
TMN3YER113C UTH1P36135 365 aa2.31□□□□□ -2.04
TMN3YER113C PIM1P36775 1133 aa2.31□□□□□ -2.04
TMN3YER113C HEK2P38199 381 aaKnown RBP RIP-Chip data2.31□□□□□ -2.04not detected
TMN3YER113C TRM7P38238 310 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
TMN3YER113C SEC31P38968 1273 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
TMN3YER113C SWD1P39706 426 aa2.31□□□□□ -2.04
TMN3YER113C ERV46P39727 415 aa2.31□□□□□ -2.04
TMN3YER113C NDE1P40215 560 aa2.31□□□□□ -2.04
TMN3YER113C VMA13P41807 478 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
TMN3YER113C YFL015CP43578 164 aa2.31□□□□□ -2.04
TMN3YER113C YFR020WP43600 232 aa2.31□□□□□ -2.04
TMN3YER113C YJR030CP47101 745 aa2.31□□□□□ -2.04
TMN3YER113C YJR154WP47181 346 aa2.31□□□□□ -2.04
TMN3YER113C PUS4P48567 403 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
TMN3YER113C NAS6P50086 228 aa2.31□□□□□ -2.04
TMN3YER113C MRM2P53123 320 aa2.31□□□□□ -2.04
TMN3YER113C NOP19P53317 196 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
TMN3YER113C SUB1P54000 292 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
TMN3YER113C RHO3Q00245 231 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
TMN3YER113C FMN1Q03778 218 aa2.31□□□□□ -2.04
TMN3YER113C ORM2Q06144 216 aa2.31□□□□□ -2.04
TMN3YER113C PFA4Q12006 378 aa2.31□□□□□ -2.04
TMN3YER113C YDR056CQ12025 205 aa2.31□□□□□ -2.04
TMN3YER113C SEN1Q00416 2231 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
TMN3YER113C FUR1P18562 216 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C ART10P18634 518 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C NUP1P20676 1076 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C DBR1P24309 405 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C SDH3P33421 198 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C NTR2P36118 322 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C FTH1P38310 465 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C INM1P38710 295 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C ARN1P38731 627 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C GGC1P38988 300 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C ZIM17P42844 174 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C FET5P43561 622 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C CIS3P47001 227 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C CUS2P53830 285 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C YNL260CP53846 198 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C AAT1Q01802 451 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C EGD1Q02642 157 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C GIP3Q03016 1276 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C RIM13Q03792 727 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C YML096WQ04489 525 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C MLC2Q06580 163 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C RAD34Q06665 692 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C YLR413WQ06689 675 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C YLR049CQ12110 428 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C YPR011CQ12251 326 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C YCL012CQ8J0M4 134 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C POL2P21951 2222 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C CAR1P00812 333 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C COS2P0CX12 379 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C COS3P0CX13 379 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C OCA4P25366 362 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C CAF4P36130 643 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C ARA1P38115 344 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C YPT10P38146 199 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C BMT2P38278 337 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C RFC3P38629 340 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C MTG2P38860 518 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C MET18P40469 1032 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C YPS6P40583 537 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C SEC27P41811 889 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C COS4P43542 379 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C COG2P53271 262 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C RTS3P53289 263 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C YNL010WP53981 241 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C YMR111CQ04461 462 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C RRN11Q04712 507 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C BNA5Q05979 453 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C ESA1Q08649 445 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C UAF30Q08747 228 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C YPL245WQ12179 454 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C YOL114CQ12322 202 aa2.3□□□□□ -2.04
TMN3YER113C RKM5Q12367 367 aa2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.7 ms