RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeastyeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSA4YER103W LSB6P42951 607 aa12.17□□□□□ -0.46
SSA4YER103W SCS3P53012 380 aa12.17□□□□□ -0.46
SSA4YER103W IMO32P53219 342 aa12.17□□□□□ -0.46
SSA4YER103W FYV6P53913 173 aa12.17□□□□□ -0.46
SSA4YER103W YPR172WQ06608 200 aa12.17□□□□□ -0.46
SSA4YER103W HBT1Q07653 1046 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
SSA4YER103W YTM1Q12024 460 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
SSA4YER103W CKS1P20486 150 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
SSA4YER103W APM3P38153 483 aa12.16□□□□□ -0.46
SSA4YER103W MBP1P39678 833 aa12.16□□□□□ -0.46
SSA4YER103W INN1P53901 409 aa12.16□□□□□ -0.46
SSA4YER103W FRE5Q08908 694 aa12.16□□□□□ -0.46
SSA4YER103W SFG1Q12507 346 aa12.16□□□□□ -0.46
SSA4YER103W RPS9BP05755 195 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
SSA4YER103W MAS2P11914 482 aa12.15□□□□□ -0.46
SSA4YER103W NAR1P23503 491 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
SSA4YER103W DCC1P25559 380 aa12.15□□□□□ -0.46
SSA4YER103W ACB1P31787 87 aa12.15□□□□□ -0.46
SSA4YER103W CTF13P35203 478 aa12.15□□□□□ -0.46
SSA4YER103W YCR087C-AP37263 153 aa12.15□□□□□ -0.46
SSA4YER103W YBR063CP38083 404 aa12.15□□□□□ -0.46
SSA4YER103W COS111P38308 924 aa12.15□□□□□ -0.46
SSA4YER103W GND1P38720 489 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
SSA4YER103W YHR202WP38887 602 aa12.15□□□□□ -0.46
SSA4YER103W AIM10P39965 576 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
SSA4YER103W MPS1P54199 764 aa12.15□□□□□ -0.46
SSA4YER103W TDA1Q03533 586 aa12.15□□□□□ -0.46
SSA4YER103W LAT1P12695 482 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
SSA4YER103W FUS3P16892 353 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
SSA4YER103W BUD5P25300 642 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
SSA4YER103W CYS3P31373 394 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
SSA4YER103W PET127P32606 800 aa12.15□□□□□ -0.46
SSA4YER103W APL3P38065 1025 aa12.15□□□□□ -0.46
SSA4YER103W YHR035WP38769 630 aa12.15□□□□□ -0.46
SSA4YER103W QDR2P40474 542 aa12.15□□□□□ -0.46
SSA4YER103W PPT1P53043 513 aa12.15□□□□□ -0.46
SSA4YER103W PLB2Q03674 706 aa12.15□□□□□ -0.46
SSA4YER103W YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
SSA4YER103W YDR056CQ12025 205 aa12.15□□□□□ -0.46
SSA4YER103W REP2P03872 296 aa12.14□□□□□ -0.47
SSA4YER103W ARO3P14843 370 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
SSA4YER103W RSA4P25382 515 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
SSA4YER103W THI80P35202 319 aa12.14□□□□□ -0.47
SSA4YER103W LDB7P38210 180 aa12.14□□□□□ -0.47
SSA4YER103W BMT2P38278 337 aa12.14□□□□□ -0.47
SSA4YER103W TES1P41903 349 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
SSA4YER103W BUD9P53226 547 aa12.14□□□□□ -0.47
SSA4YER103W YMR130WQ04223 302 aa12.14□□□□□ -0.47
SSA4YER103W VPS74Q06385 345 aa12.14□□□□□ -0.47
SSA4YER103W RTC5Q12108 567 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
SSA4YER103W RDS2P19541 446 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
SSA4YER103W IDH1P28834 360 aaKnown RBP RIP-Chip data12.13□□□□□ -0.47not detected
SSA4YER103W SFP1P32432 683 aa12.13□□□□□ -0.47
SSA4YER103W YPT7P32939 208 aa12.13□□□□□ -0.47
SSA4YER103W TKL2P33315 681 aa12.13□□□□□ -0.47
SSA4YER103W KSP1P38691 1029 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
SSA4YER103W MSS11Q03825 758 aa12.13□□□□□ -0.47
SSA4YER103W SNX41Q04053 625 aa12.13□□□□□ -0.47
SSA4YER103W BNA7Q04066 261 aa12.13□□□□□ -0.47
SSA4YER103W LYS21Q12122 440 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
SSA4YER103W SIR2P06700 562 aa12.13□□□□□ -0.47
SSA4YER103W SWI5P08153 709 aa12.13□□□□□ -0.47
SSA4YER103W SIS1P25294 352 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
SSA4YER103W ALY1P36117 915 aa12.13□□□□□ -0.47
SSA4YER103W LSM5P40089 93 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
SSA4YER103W YMR144WP40214 342 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
SSA4YER103W STE24P47154 453 aa12.13□□□□□ -0.47
SSA4YER103W GCV1P48015 400 aa12.13□□□□□ -0.47
SSA4YER103W YGR026WP53217 278 aa12.13□□□□□ -0.47
SSA4YER103W YDR132CQ03900 495 aa12.13□□□□□ -0.47
SSA4YER103W SPO77Q06134 477 aa12.13□□□□□ -0.47
SSA4YER103W YLR352WQ06479 807 aa12.13□□□□□ -0.47
SSA4YER103W MRPL35Q06678 367 aa12.13□□□□□ -0.47
SSA4YER103W YEH1Q07804 573 aa12.13□□□□□ -0.47
SSA4YER103W PLB3Q08108 686 aa12.13□□□□□ -0.47
SSA4YER103W AIM7Q12156 149 aa12.13□□□□□ -0.47
SSA4YER103W MRPL40P36534 297 aa12.12□□□□□ -0.47
SSA4YER103W CTF8P38877 133 aa12.12□□□□□ -0.47
SSA4YER103W YDR541CQ03049 344 aa12.12□□□□□ -0.47
SSA4YER103W NUT2Q06213 157 aa12.12□□□□□ -0.47
SSA4YER103W YLR173WQ06247 608 aa12.12□□□□□ -0.47
SSA4YER103W YRM1Q12340 786 aa12.12□□□□□ -0.47
SSA4YER103W YCL012CQ8J0M4 134 aa12.12□□□□□ -0.47
SSA4YER103W CIT2P08679 460 aa12.11□□□□□ -0.47
SSA4YER103W DBP1P24784 617 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
SSA4YER103W RMA1P36001 430 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
SSA4YER103W YKL151CP36059 337 aa12.11□□□□□ -0.47
SSA4YER103W HOS2P53096 452 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
SSA4YER103W BUD17P53727 317 aa12.11□□□□□ -0.47
SSA4YER103W SSL1Q04673 461 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
SSA4YER103W MRX4Q12467 430 aa12.11□□□□□ -0.47
SSA4YER103W MHT1Q12525 324 aa12.11□□□□□ -0.47
SSA4YER103W MSS51P32335 436 aa12.11□□□□□ -0.47
SSA4YER103W COQ2P32378 372 aa12.11□□□□□ -0.47
SSA4YER103W PDC2P32896 925 aa12.11□□□□□ -0.47
SSA4YER103W ASC1P38011 319 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
SSA4YER103W POL12P38121 705 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
SSA4YER103W NSG1P38837 291 aa12.11□□□□□ -0.47
SSA4YER103W KTR7P40504 517 aa12.11□□□□□ -0.47
SSA4YER103W VPS73P53142 486 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
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