RNA–Protein interactions for RNA: YDR457W

TOM1, Transcript of E3 ubiquitin ligase of the hect-domain class, yeast

Gene TOM1, Length 9,807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOM1	YDR457W	MIG2	P53035	382 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RPN14	P53196	417 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	TAF9	Q05027	157 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	BRE4	Q07660	1125 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	REX4	Q08237	289 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	TRM8	Q12009	286 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	TSC13	Q99190	310 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MYO4	P32492	1471 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PRR1	P28708	518 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ERG3	P32353	365 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ECM31	P38122	312 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	LCB2	P40970	561 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RUB1	Q03919	77 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ASR1	Q06834	288 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YDL206W	Q12424	762 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RGT1	P32862	1170 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MRPL17	P36528	281 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CDC27	P38042	758 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ESBP6	P53918	673 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YNL092W	P53934	400 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MSC1	Q03104	513 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YMR155W	Q03795	547 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	HVG1	P0CE11	249 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	UNG1	P12887	359 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MRS4	P23500	304 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	TIP20	P33891	701 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RPH1	P39956	796 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SAD1	P43589	448 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YJL043W	P47053	257 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ISM1	P48526	1002 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	DIA1	P54005	336 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YPL077C	Q02831	240 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ISU1	Q03020	165 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	TRS31	Q03337	283 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YLR046C	Q12253	270 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	IQG1	Q12280	1495 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	OCA4	P25366	362 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.66	□□□□□ -1.98	not detected
TOM1	YDR457W	SET3	P36124	751 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YPC1	P38298	316 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CPR7	P47103	393 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	EAF6	P47128	113 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ORC4	P54791	529 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	OST6	Q03723	332 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YMR074C	Q04773	145 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	POM34	Q12445	299 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	REV1	P12689	985 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	GEX1	P25596	615 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	GTS1	P40956	396 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	GPI8	P49018	411 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PDR17	P53844	350 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YML131W	Q03102	365 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YML018C	Q03730	393 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	STE3	P06783	470 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	HAP4	P14064	554 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MDL1	P33310	695 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MAF1	P41910	395 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CTR1	P49573	406 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CIA1	Q05583	330 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	HRD3	Q05787	833 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ISU2	Q12056	156 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PUP1	P25043	261 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CPR4	P25334	318 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SFP1	P32432	683 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RCK1	P38622	512 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.66	□□□□□ -1.98	not detected
TOM1	YDR457W	SEO1	P39709	593 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ATG32	P40458	529 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YJR124C	P47159	448 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	AAH1	P53909	347 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SNO4	Q04902	237 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MFB1	Q04922	465 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	GUD1	Q07729	489 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	HSP32	Q08992	237 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	KOG1	P38873	1557 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	URA3	P03962	267 aa		2.66	□□□□□ -1.98

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