RNA–Protein interactions for RNA: YAL058W

CNE1, Transcript of Calnexin, yeast

Gene CNE1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CNE1	YAL058W	PPQ1	P32945	549 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	HSE1	P38753	452 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	YKE4	P40544	346 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	SSU1	P41930	458 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	MUP1	P50276	574 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	MNT2	P53059	558 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	AQR1	P53943	586 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	AAT1	Q01802	451 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	RNH1	Q04740	348 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	YPR114W	Q06107	315 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	YLR346C	Q06139	101 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	COS7	Q07788	383 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	PNS1	Q12412	539 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	NSI1	Q12457	570 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	IRA2	P19158	3079 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	STE3	P06783	470 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	RSR1	P13856	272 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	CLN2	P20438	545 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	PUP1	P25043	261 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	EMC3	P36039	253 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	SRX1	P36077	127 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	PCL5	P38794	229 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	RRG9	P40156	214 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	BIT61	P47041	543 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	YJL043W	P47053	257 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	YJR098C	P47139	656 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	EMC4	P53073	190 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	ATG29	Q12092	213 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	YPR1	Q12458	312 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	MET2	P08465	486 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	MET8	P15807	274 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	MNE1	P24720	663 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	ATP11	P32453	318 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	LYP1	P32487	611 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	TOD6	P34219	525 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	YEL073C	P39974	107 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	QDR2	P40474	542 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	HMS2	P47175	358 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	COG7	P53195	279 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	MKC7	P53379	596 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	YNL140C	P53910	189 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	YAT1	P80235	687 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	GIP3	Q03016	1276 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	VPS74	Q06385	345 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	RRT8	Q08219	342 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	HAL9	Q12180	1030 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	SIA1	Q12212	622 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	YPR011C	Q12251	326 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	SRN2	Q99176	213 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	TSC13	Q99190	310 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	YPR096C	O13587	100 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	ATG22	P25568	528 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.72	□□□□□ -1.49	not detected
CNE1	YAL058W	NDC1	P32500	655 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	RML2	P32611	393 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	PMT1	P33775	817 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	SSN3	P39073	555 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	PAC11	P40960	533 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	YGR015C	P53208	328 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	YNL260C	P53846	198 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.72	□□□□□ -1.49	not detected
CNE1	YAL058W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	YML108W	Q03759	105 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	OPT2	Q06593	877 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	SYO1	Q07395	620 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	YDR061W	Q12298	539 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	YOR012W	Q12351	137 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	GTT2	Q12390	233 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CNE1	YAL058W	SWI5	P08153	709 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CNE1	YAL058W	MER1	P16523	270 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CNE1	YAL058W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
CNE1	YAL058W	RSC6	P25632	483 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CNE1	YAL058W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
CNE1	YAL058W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
CNE1	YAL058W	YIM1	P28625	365 aa		5.71	□□□□□ -1.5

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