RNA–Protein interactions for RNA: Q0055

AI2, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI2	Q0055	MED2	Q12124	431 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	APC2	Q12440	853 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	SPO24	Q3E752	67 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	ATP6	P00854	259 aa		2.65	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	HEM15	P16622	393 aa		2.65	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	VMA16	P23968	213 aa		2.65	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	PBN1	P25580	416 aa		2.65	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	SPT10	P35208	640 aa		2.65	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	RIB1	P38066	345 aa		2.65	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	YHC3	P47040	408 aa		2.65	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	HOC1	P47124	396 aa		2.65	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	2.65	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	DIA1	P54005	336 aa		2.65	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	LOT6	Q07923	191 aa		2.65	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	AAD15	Q08361	143 aa		2.65	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	YDR061W	Q12298	539 aa		2.65	□□□□□ -1.98
AI2	Q0055	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	YLR278C	Q05854	1341 aa		2.65	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	BOS1	P25385	244 aa		2.65	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	ADY2	P25613	283 aa		2.65	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	MRPS5	P33759	307 aa		2.65	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	SAD1	P43589	448 aa		2.65	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	YFR057W	P43625	151 aa		2.65	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	NMA2	P53204	395 aa		2.65	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	YGR067C	P53243	804 aa		2.65	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	2.65	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	YGR117C	P53270	476 aa		2.65	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	SLI1	P53304	468 aa		2.65	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	GPI15	P53961	229 aa		2.65	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	TAF12	Q03761	539 aa		2.65	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	MSS11	Q03825	758 aa		2.65	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	PLM2	Q04383	521 aa		2.65	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	GIM5	Q04493	163 aa		2.65	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	2.65	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	YOS9	Q99220	542 aa		2.65	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	UBA3	Q99344	299 aa		2.65	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	SPS4	P09937	338 aa		2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	GAC1	P28006	793 aa		2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.64	□□□□□ -1.99	not detected
AI2	Q0055	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.64	□□□□□ -1.99	not detected
AI2	Q0055	DOA1	P36037	715 aa		2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	RCK2	P38623	610 aa		2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	BIG1	P38813	335 aa		2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	PIG2	P40187	538 aa		2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	YRB2	P40517	327 aa		2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	UBX6	P47049	396 aa		2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	OKP1	P53298	406 aa		2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	ESBP6	P53918	673 aa		2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	SLT2	Q00772	484 aa		2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	RSM23	Q01163	450 aa		2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	YML053C	Q04978	212 aa		2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	RTT103	Q05543	409 aa		2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	USV1	Q12132	391 aa		2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	MSH5	Q12175	901 aa		2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	LAM4	P38800	1345 aa		2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	OPI3	P05375	206 aa		2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	MAS2	P11914	482 aa		2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	CDC23	P16522	626 aa		2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	GPI12	P23797	304 aa		2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	COQ3	P27680	312 aa		2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	SPO23	P33757	523 aa		2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	KDX1	P36005	433 aa		2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	APT2	P36973	181 aa		2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	YBR096W	P38256	230 aa		2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	INM1	P38710	295 aa		2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	SPC97	P38863	823 aa		2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	YHR182W	P38870	785 aa		2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	UBP5	P39944	805 aa		2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	FMC1	P40491	155 aa		2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	KEG1	P43614	200 aa		2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.64	□□□□□ -1.99	not detected
AI2	Q0055	NAS6	P50086	228 aa		2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	VOA1	P53262	265 aa		2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	RHO4	Q00246	291 aa		2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	UBX2	Q04228	584 aa		2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	BUR2	Q05949	395 aa		2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	NRT1	Q08485	598 aa		2.64	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	RAD57	P25301	460 aa		2.63	□□□□□ -1.99
AI2	Q0055	GSY2	P27472	705 aa		2.63	□□□□□ -1.99

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.4 ms