RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W RPC40P07703 335 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W KGD2P19262 463 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W BUD5P25300 642 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W GSH1P32477 678 aa9.86□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W PLB1P39105 664 aa9.86□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W DOT6P40059 670 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W VPS25P47142 202 aa9.86□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W RRN9P53437 365 aa9.86□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W YNL260CP53846 198 aa9.86□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W FDC1Q03034 503 aa9.86□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W RPN4Q03465 531 aa9.86□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W NSE5Q03718 556 aa9.86□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W TRM82Q03774 444 aa9.86□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W YMR087WQ04299 284 aa9.86□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W YLR283WQ05867 314 aa9.86□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W TRM8Q12009 286 aa9.86□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W MRX4Q12467 430 aa9.86□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W YPR096CO13587 100 aa9.85□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W STE3P06783 470 aa9.85□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W SST2P11972 698 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W IDH1P28834 360 aaKnown RBP RIP-Chip data9.85□□□□□ -0.83not detected
PRP4YPR178W RNP1P32385 249 aa9.85□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W RPS0AP32905 252 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W ASH1P34233 588 aa9.85□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W LOT5P34234 306 aa9.85□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W PHO11P35842 467 aa9.85□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W YKR051WP36142 418 aa9.85□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W MRPL40P36534 297 aa9.85□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W SIF2P38262 535 aa9.85□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W PHO12P38693 467 aa9.85□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W VRG4P40107 337 aa9.85□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W YTA6P40328 754 aa9.85□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W RPL34BP40525 121 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W AAD14P42884 376 aa9.85□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W YFL052WP43551 465 aa9.85□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W ATG18P43601 500 aa9.85□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W YNL140CP53910 189 aa9.85□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W HEH2Q03281 663 aa9.85□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W GCN5Q03330 439 aa9.85□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W VHS1Q03785 461 aa9.85□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W FEX1Q08913 375 aa9.85□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W LEA1Q08963 238 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W ENV7Q12003 364 aa9.85□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W TFB4Q12004 338 aa9.85□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W YTM1Q12024 460 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W YPL245WQ12179 454 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W YOR012WQ12351 137 aa9.85□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W SFG1Q12507 346 aa9.85□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W YAR066WP0CX18 203 aa9.84□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W YHR214WP0CX19 203 aa9.84□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W RAM1P22007 431 aa9.84□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W SYP1P25623 870 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W ERG9P29704 444 aa9.84□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W NDC1P32500 655 aa9.84□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W PET309P32522 965 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W TSA1P34760 196 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W HMT1P38074 348 aa9.84□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W YBR071WP38243 211 aa9.84□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W HSE1P38753 452 aa9.84□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W ERG10P41338 398 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W ZRG17P53735 605 aa9.84□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W SNZ1Q03148 297 aa9.84□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W GPN3Q06543 272 aa9.84□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W CLP1Q08685 445 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W FEX2Q08991 375 aa9.84□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W DIN7Q12086 430 aa9.84□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W RRP42Q12277 265 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PRP4YPR178W FLP1P03870 423 aa9.83□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W SPS2P08459 502 aa9.83□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W PET54P10834 293 aa9.83□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W CPR3P25719 182 aa9.83□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W CAT2P32796 670 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W PRP18P33411 251 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W ANR2P36090 516 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W ALY1P36117 915 aa9.83□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W MRPL3P36516 390 aa9.83□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W YBR063CP38083 404 aa9.83□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W CTF8P38877 133 aa9.83□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W UFE1P41834 346 aa9.83□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W AMA1P50082 593 aa9.83□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W TDA1Q03533 586 aa9.83□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W MFB1Q04922 465 aa9.83□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W PHO5P00635 467 aa9.82□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W RAD52P06778 471 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W MSF1P08425 469 aa9.82□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W MET2P08465 486 aa9.82□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W COQ8P27697 501 aa9.82□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W MSS1P32559 526 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W VPH1P32563 840 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W MNN2P38069 597 aa9.82□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W MAP2P38174 421 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W YBR137WP38276 179 aa9.82□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W IFA38P38286 347 aa9.82□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W BIG1P38813 335 aa9.82□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W YIL089WP40500 205 aa9.82□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W YGR201CP42936 225 aa9.82□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W LSM1P47017 172 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W YJL043WP47053 257 aa9.82□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W ECM27P47144 725 aa9.82□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W YGR067CP53243 804 aa9.82□□□□□ -0.84
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