RNA–Protein interactions for RNA: YPL157W

TGS1, Transcript of Trimethyl guanosine synthase, conserved nucleolar methyl transferase, yeast

Gene TGS1, Length 948 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TGS1	YPL157W	DCN1	Q12395	269 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TGS1	YPL157W	AHC1	Q12433	566 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TGS1	YPL157W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
TGS1	YPL157W	FMP16	Q12497	93 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TGS1	YPL157W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TGS1	YPL157W	YPT6	Q99260	215 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TGS1	YPL157W	YOR093C	Q12275	1648 aa		4.65	□□□□□ -1.66
TGS1	YPL157W	SPO14	P36126	1683 aa		4.65	□□□□□ -1.66
TGS1	YPL157W	COX1	P00401	534 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	ARG3	P05150	338 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	GAL3	P13045	520 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	ATR1	P13090	542 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	MRPL9	P31334	269 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	TFC1	P32367	649 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	SIP1	P32578	815 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	MRP4	P32902	394 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	HES1	P35843	434 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	NUP133	P36161	1157 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	MRPL37	P36532	105 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	ARA1	P38115	344 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	PKP1	P40530	394 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	MND1	P53102	219 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	YSA1	Q01976	231 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	YMR279C	Q03263	540 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	VHS1	Q03785	461 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	SNX41	Q04053	625 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	ARG7	Q04728	441 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	HRD3	Q05787	833 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	MHR1	Q06630	226 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	GRS2	Q06817	618 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	ENT4	Q07872	247 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	RGT2	Q12300	763 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	ATG31	Q12421	196 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	SKM1	Q12469	655 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	LAG2	Q92325	660 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	YPK2	P18961	677 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	YSP3	P25036	478 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	CPR3	P25719	182 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	FUN26	P31381	517 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	RGT1	P32862	1170 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	PCL7	P40186	285 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	UBP7	P40453	1071 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	ASG1	P40467	964 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	GTT1	P40582	234 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	SAE2	P46946	345 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	NMD5	P46970	1048 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	RPC17	P47076	161 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	MSY1	P48527	492 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	YGL108C	P53139	140 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	YNR068C	P53754	272 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	SPC19	Q03954	165 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	RTT103	Q05543	409 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	FEX2	Q08991	375 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	RCN2	Q12044	265 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	NUS1	Q12063	375 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	RAD61	Q99359	647 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	MET2	P08465	486 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	MRP13	P12686	339 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	MET8	P15807	274 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	SRB5	P32585	307 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	TFB1	P32776	642 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	ALY1	P36117	915 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	SLM4	P38247	162 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	FRT2	P39734	528 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	SOK1	P40317	901 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	CSM2	P40465	213 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	ZIM17	P42844	174 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	YGR210C	P42942	411 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TGS1	YPL157W	DIE2	P50076	525 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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