RNA–Protein interactions for RNA: YML043C

RRN11, Transcript of Component of the core factor (CF) rDNA transcription factor complex, yeast

Gene RRN11, Length 1,524 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN11	YML043C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	RCO1	Q04779	684 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	REH1	Q06709	432 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	ZEO1	Q08245	113 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	MCH5	Q08777	521 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	YPL272C	Q08984	517 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	YPR202W	Q08993	238 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	YLL058W	Q12198	575 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	FYV7	Q12247	151 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	SVS1	Q12254	260 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	RPN6	Q12377	434 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	HTB2	P02294	131 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	TPK2	P06245	380 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	PRB1	P09232	635 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	DAL81	P21657	970 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	YCK1	P23291	538 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	UTR4	P32626	227 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	SHP1	P34223	423 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	MCD4	P36051	919 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	CST26	P38226	397 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	SUR2	P38992	349 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	STL1	P39932	569 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	DOT5	P40553	215 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	MNN5	P46982	586 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	LOH1	P47055	219 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	IRC18	P47056	224 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	BNA1	P47096	177 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	DSD1	P53095	428 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	PIB2	P53191	635 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	YGR042W	P53227	271 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	SHY1	P53266	389 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	TNA1	P53322	534 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	MTQ1	P53944	314 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	PFA5	Q03289	374 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	VPS74	Q06385	345 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	ATG33	Q06485	197 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	HIM1	Q06674	414 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	ASA1	Q06822	443 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	SLD7	Q08457	257 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	NCB2	Q92317	146 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	SAS5	Q99314	248 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	ERG11	P10614	530 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	SNF4	P12904	322 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	URA6	P15700	204 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	MRPL44	P19956	98 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	SIR1	P21691	654 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	PER1	P25625	357 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	IMG1	P25626	169 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	CDC50	P25656	391 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	SSH4	P32343	579 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	HYM1	P32464	399 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	SIP1	P32578	815 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	PTM1	P32857	523 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	ECM13	P38195	257 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	MMS4	P38257	691 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	FTH1	P38310	465 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	COS8	P38723	381 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	NPR2	P39923	615 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	KRE29	P40026	464 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	SCC4	P40090	624 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	YER158C	P40095	573 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	SKP2	P42843	763 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	YFL054C	P43549	646 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	NIT2	P47016	307 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	RTT101	P47050	842 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	YJR030C	P47101	745 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	AMA1	P50082	593 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	MRK1	P50873	501 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	UFD1	P53044	361 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.12	□□□□□ -1.75	not detected
RRN11	YML043C	HDA1	P53973	706 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	MET14	Q02196	202 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	PEX25	Q02969	394 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	GIM5	Q04493	163 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	GUP2	Q08929	609 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75

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