RNA–Protein interactions for RNA: YLR363C

NMD4, Transcript of Protein that may be involved in nonsense-mediated mRNA decay, yeast

Gene NMD4, Length 657 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NMD4	YLR363C	FMP27	Q06179	2628 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NMD4	YLR363C	RAD3	P06839	778 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NMD4	YLR363C	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NMD4	YLR363C	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NMD4	YLR363C	RRT12	P25381	491 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NMD4	YLR363C	NDC1	P32500	655 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NMD4	YLR363C	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NMD4	YLR363C	YBR056W	P38081	501 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NMD4	YLR363C	SIF2	P38262	535 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NMD4	YLR363C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NMD4	YLR363C	FLC2	P39719	783 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NMD4	YLR363C	AIM20	P40451	204 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NMD4	YLR363C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NMD4	YLR363C	CPR7	P47103	393 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NMD4	YLR363C	LCL3	P53153	274 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NMD4	YLR363C	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.66	□□□□□ -1.66	not detected
NMD4	YLR363C	VPS60	Q03390	229 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NMD4	YLR363C	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NMD4	YLR363C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.66	□□□□□ -1.66	not detected
NMD4	YLR363C	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NMD4	YLR363C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	CDC42	P19073	191 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	CLN1	P20437	546 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	PTR2	P32901	601 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	YBR225W	P38321	900 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	YHR210C	P38893	341 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	FHL1	P39521	936 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	AVT2	P39981	480 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	BUD32	P53323	261 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	NDL1	Q06568	189 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	YEH1	Q07804	573 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	NFI1	Q12216	726 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	TEL1	P38110	2787 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	SEM1	O94742	89 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	REV1	P12689	985 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	CLB1	P24868	471 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	CPR3	P25719	182 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	MSP1	P28737	362 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	PSO2	P30620	661 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	KRE9	P39005	276 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	CCT6	P39079	546 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	RPH1	P39956	796 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	RSM25	P40496	264 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	YJR154W	P47181	346 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	YDL186W	P48568	277 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	NUP84	P52891	726 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	NGL3	Q03210	505 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	RCF1	Q03713	159 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	PPM1	Q04081	328 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	YOR365C	Q08844	703 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	SET6	Q12529	373 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	SEC39	Q12745	709 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	MRP13	P12686	339 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	ECM13	P38195	257 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	VPS52	P39904	641 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	OSW5	P40219	148 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	ALG5	P40350	334 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	SEC9	P40357	651 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	YJL213W	P40896	331 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	MND1	P53102	219 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	RSC1	P53236	928 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	YLR297W	Q05899	129 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	SYO1	Q07395	620 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	DDC1	Q08949	612 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	YDR056C	Q12025	205 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	YPT6	Q99260	215 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	JIP3	O13555	125 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	ATS1	P31386	333 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	SGE1	P33335	543 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	SEF1	P34228	1148 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	CSG2	P35206	410 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	YHR218W	P38899	603 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	RPR2	P40571	144 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	UFE1	P41834	346 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	RMD8	P43620	662 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	COS10	P52924	374 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	IPI3	P53877	555 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	GYL1	Q04322	720 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	BNA5	Q05979	453 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	ARR1	Q06596	294 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	YDL009C	Q12210	107 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	GLE1	Q12315	538 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NMD4	YLR363C	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67

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