RNA–Protein interactions for RNA: YLR087C

CSF1, Transcript of Protein required for fermentation at low temperature, yeast

Gene CSF1, Length 8,877 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSF1	YLR087C	NDJ1	Q12366	352 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	TY2B-B	Q12491	1770 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	AI4	P03878	556 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	ATP5	P09457	212 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	PCK1	P10963	549 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.24	□□□□□ -2.05	not detected
CSF1	YLR087C	MSS51	P32335	436 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	YPT7	P32939	208 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	SLC1	P33333	303 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	YPT11	P48559	417 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	GND2	P53319	492 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	YLR407W	Q06070	228 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	YPR022C	Q12139	1133 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	SIA1	Q12212	622 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	MAS1	P10507	462 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	GIT1	P25346	518 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	DMC1	P25453	334 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	PET10	P36139	283 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	CHA4	P43634	648 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	YDR222W	Q04925	415 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	YPR117W	Q06116	2489 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	AI1	P03875	834 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	RAD7	P06779	565 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	CBP1	P07252	654 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	ALG1	P16661	449 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	STE18	P18852	110 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	TRK2	P28584	889 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	MMS4	P38257	691 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	YKE4	P40544	346 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	HXT8	P40886	569 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	HXT14	P42833	540 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	LST7	P53237	242 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	BOP3	P53958	396 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	SEG1	Q04279	960 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	SPH1	Q06160	661 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	PEX27	Q08580	376 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	MET7	Q08645	548 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	TRM13	Q12383	476 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	MDM12	Q92328	271 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	SGA1	P08019	549 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	ARG8	P18544	423 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	GPI12	P23797	304 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	HXT4	P32467	576 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	LIP5	P32875	414 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	IST2	P38250	946 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	AIM18	P38884	321 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	YER186C	P40101	306 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	ATF1	P40353	525 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	SDP1	P40479	209 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	AGP3	P43548	558 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	FET5	P43561	622 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	CAF16	P43569	289 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	GTO1	P48239	356 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	YMD8	Q03697	442 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	IVY1	Q04934	453 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	GSH2	Q08220	491 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	NUS1	Q12063	375 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	FCY1	Q12178	158 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	RPN6	Q12377	434 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	RMD5	Q12508	421 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	RAS1	P01119	309 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	CDC6	P09119	513 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	FBP1	P09201	348 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	RIT1	P23796	513 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.24	□□□□□ -2.05	not detected
CSF1	YLR087C	FRE1	P32791	686 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	GIP1	P38229	639 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	PFF1	P38244	976 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	SOH1	P38633	127 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	NAS6	P50086	228 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	MDY2	Q12285	212 aa		2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	2.24	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		2.23	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	SNF6	P18888	332 aa		2.23	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	AME1	P38313	324 aa		2.23	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	MSR1	P38714	643 aa		2.23	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	NIT1	P40447	199 aa		2.23	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	AVT7	P40501	490 aa		2.23	□□□□□ -2.05
CSF1	YLR087C	HIT1	P46973	164 aa		2.23	□□□□□ -2.05

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.2 ms