RNA–Protein interactions for RNA: YJR104C

SOD1, Transcript of Cytosolic copper-zinc superoxide dismutase, yeast

Gene SOD1, Length 465 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOD1	YJR104C	APA2	P22108	325 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	YCK1	P23291	538 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	PRP28	P23394	588 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	YCR101C	P25607	182 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	CIN8	P27895	1000 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	NAM9	P27929	486 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	DBF4	P32325	704 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	YSC84	P32793	468 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	TOD6	P34219	525 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	SPT10	P35208	640 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	GPX2	P38143	162 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	SIF2	P38262	535 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	MSR1	P38714	643 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	BIG1	P38813	335 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.41	□□□□□ -1.86	not detected
SOD1	YJR104C	TAT2	P38967	592 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	YER184C	P39961	794 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	YKE4	P40544	346 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	TIR3	P40552	269 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	CAF16	P43569	289 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	YJR030C	P47101	745 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	CPR7	P47103	393 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	ECM27	P47144	725 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	TOM22	P49334	152 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	SPT20	P50875	604 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	PMT5	P52867	743 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	YGL138C	P53122	345 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	YGR026W	P53217	278 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	YGR045C	P53229	120 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	MNT4	P53745	580 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	FOL1	P53848	824 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	YPL107W	Q02873	248 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	RRN5	Q02983	363 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	RSM10	Q03201	203 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	ATG16	Q03818	150 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	SNX41	Q04053	625 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	YET2	Q04210	160 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	SWF1	Q04629	336 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	GRS2	Q06817	618 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	THI73	Q07904	523 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	ULA1	Q12059	462 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	PUS9	Q12069	462 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	MDM32	Q12171	622 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	YOR012W	Q12351	137 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SOD1	YJR104C	CIT1	P00890	479 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	BI2	P03873	423 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	STE3	P06783	470 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	IMA3	P0CW40	589 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	IMA4	P0CW41	589 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	CDC23	P16522	626 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	PHO81	P17442	1178 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	UGA1	P17649	471 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	AAC3	P18238	307 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	DMC1	P25453	334 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YCL049C	P25577	312 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	CSM1	P25651	190 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	MGT1	P26188	188 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	DAL80	P26343	269 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	COQ2	P32378	372 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	GSH1	P32477	678 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	KRE6	P32486	720 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	MEI5	P32489	222 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SIP1	P32578	815 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ORC2	P32833	620 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	NNK1	P36003	928 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	RRN3	P36070	627 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YBR241C	P38142	488 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YHK8	P38776	514 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	MNN1	P39106	762 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YEL020C	P39994	560 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	PIG2	P40187	538 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SLM1	P40485	686 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	CIN1	P40987	1014 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SER2	P42941	309 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ALR2	P43553	858 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	RET2	P43621	546 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SAE2	P46946	345 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	AIM14	P53109	570 aa		3.4	□□□□□ -1.87

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