RNA–Protein interactions for RNA: YJL112W

MDV1, Transcript of Peripheral protein of cytosolic face of mitochondrial outer membrane, yeast

Gene MDV1, Length 2,145 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MDV1	YJL112W	APL1	P27351	700 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	HES1	P35843	434 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	LDB7	P38210	180 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	POP7	P38291	140 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	YIL001W	P40560	513 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	ATG27	P46989	271 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	RNT1	Q02555	471 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	MRP51	Q02950	344 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	TAF12	Q03761	539 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	SPO77	Q06134	477 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	SYO1	Q07395	620 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	TPO1	Q07824	586 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	NSE1	Q07913	336 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	YOL075C	Q08234	1294 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	REX4	Q08237	289 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.98	□□□□□ -1.93	not detected
MDV1	YJL112W	TRP3	P00937	484 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	SCEI	P03882	235 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	CHS1	P08004	1131 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	YMR085W	P0CF18	432 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	FAR1	P21268	830 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	GPI12	P23797	304 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	CDC20	P26309	610 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	PRR1	P28708	518 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	ECM25	P32525	599 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	SPO23	P33757	523 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	GMH1	P36125	273 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	YPK3	P38070	525 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	QDR3	P38227	689 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	SPC97	P38863	823 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	NDC80	P40460	691 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	SNZ3	P43545	298 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.98	□□□□□ -1.93	RIP-Chip
MDV1	YJL112W	NPA3	P47122	385 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	SNZ2	P53824	298 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	FMP30	Q02883	468 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	YMR209C	Q03648	457 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	AIM33	Q04516	312 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	VPS74	Q06385	345 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	ATG17	Q06410	417 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	SNA4	Q07549	140 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	YOL159C	Q08300	171 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	GRE1	Q08969	168 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	YDL109C	Q12103	647 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	YLR108C	Q12259	485 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	ESP1	Q03018	1630 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	RKR1	Q04781	1562 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.97	□□□□□ -1.93	not detected
MDV1	YJL112W	BCS1	P32839	456 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	RTC2	P38279	296 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	BIG1	P38813	335 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	FET3	P38993	636 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	ECM10	P39987	644 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	PAC11	P40960	533 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	MTQ1	P53944	314 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	SHS1	Q07657	551 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	PEX27	Q08580	376 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	DNF1	P32660	1571 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	BNI1	P41832	1953 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	COX1	P00401	534 aa		2.96	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	RHO2	P06781	192 aa		2.96	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	RPO26	P20435	155 aa		2.96	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	MRPL8	P22353	238 aa		2.96	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	CMK2	P22517	447 aa		2.96	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	CNA1	P23287	553 aa		2.96	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	RBK1	P25332	333 aa		2.96	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	MSS51	P32335	436 aa		2.96	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.93
MDV1	YJL112W	SKT5	P34226	696 aa		2.96	□□□□□ -1.93

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