RNA–Protein interactions for RNA: YHL029C

OCA5, Transcript of Cytoplasmic protein required for replication of Brome mosaic virus, yeast

Gene OCA5, Length 2,040 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
OCA5	YHL029C	MBA1	P38300	278 aa		4.99	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	SHG1	P38337	142 aa		4.99	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	UBA4	P38820	440 aa		4.99	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	CYC2	P38909	366 aa		4.99	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	ICE2	P40499	491 aa		4.99	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	YJR056C	P47115	236 aa		4.99	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.99	□□□□□ -1.61	not detected
OCA5	YHL029C	CBK1	P53894	756 aa		4.99	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	HSP31	Q04432	237 aa		4.99	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	YDR109C	Q04585	715 aa		4.99	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	DCR2	Q05924	578 aa		4.99	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	YLR345W	Q06137	509 aa		4.99	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	PHO92	Q06390	306 aa		4.99	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	YET3	Q07451	203 aa		4.99	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	RFU1	Q08003	200 aa		4.99	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	CSM4	Q08955	156 aa		4.99	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	PIN2	Q12057	282 aa		4.99	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	YLR108C	Q12259	485 aa		4.99	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	PNS1	Q12412	539 aa		4.99	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	PCC1	Q3E833	88 aa		4.99	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	RGS2	Q99188	309 aa		4.99	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	FLO11	P08640	1367 aa		4.99	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	MAS2	P11914	482 aa		4.98	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
OCA5	YHL029C	MRPL9	P31334	269 aa		4.98	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
OCA5	YHL029C	TCA17	P32613	152 aa		4.98	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	MDL2	P33311	773 aa		4.98	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	YBL086C	P38177	466 aa		4.98	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	GEP4	P38812	185 aa		4.98	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	VPS45	P38932	577 aa		4.98	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	ACO2	P39533	789 aa		4.98	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	YIL166C	P40445	542 aa		4.98	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	YIL024C	P40543	189 aa		4.98	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	TOS3	P43637	560 aa		4.98	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	BUD32	P53323	261 aa		4.98	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	NUP116	Q02630	1113 aa		4.98	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	TRS31	Q03337	283 aa		4.98	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	PML39	Q03760	334 aa		4.98	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	TPP1	Q03796	238 aa		4.98	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	TMA10	Q06177	86 aa		4.98	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	GUP2	Q08929	609 aa		4.98	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	YPL066W	Q12194	479 aa		4.98	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	AGC1	Q12482	902 aa		4.98	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	STE2	D6VTK4	431 aa		4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	COQ1	P18900	473 aa		4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	BEM1	P29366	551 aa		4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	ZRT3	P34240	503 aa		4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	SSS1	P35179	80 aa		4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	TAT1	P38085	619 aa		4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	RRN10	P38204	145 aa		4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	YIL054W	P40524	105 aa		4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	IMA5	P40884	581 aa		4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	SNG1	P46950	547 aa		4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	LOH1	P47055	219 aa		4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	CTR1	P49573	406 aa		4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	TNA1	P53322	534 aa		4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	SLM2	P53955	656 aa		4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	MSC1	Q03104	513 aa		4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	CAC2	Q04199	468 aa		4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	OPT2	Q06593	877 aa		4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	SYT1	Q06836	1226 aa		4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	YLL058W	Q12198	575 aa		4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	RBD2	Q12270	262 aa		4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	YOP1	Q12402	180 aa		4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	MHF1	Q3E835	90 aa		4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	PHO80	P20052	293 aa		4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	MNE1	P24720	663 aa		4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	UBC8	P28263	218 aa		4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	YKL069W	P36088	180 aa		4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	BET3	P36149	193 aa		4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	APT2	P36973	181 aa		4.97	□□□□□ -1.61
OCA5	YHL029C	YEL025C	P39991	1188 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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